More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1719 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  64.06 
 
 		 205 aa  251  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  58.59 
 
 		 209 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  55.61 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  55.96 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  45.25 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  43.56 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 198 aa  131  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  36.95 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  37.76 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  36.08 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  40 
 
 		 705 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  32.68 
 
 		 234 aa  111  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  39.58 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  36.23 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  35.05 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  38.5 
 
 		 703 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  34.78 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  37.2 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  35.78 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37.84 
 
 		 901 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  35.58 
 
 		 243 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  34.91 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  31 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  34.62 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36.6 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  31.16 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  32.84 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  34.8 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  37.37 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  33.83 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  36.97 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  34.34 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  36.22 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  31.86 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  32.55 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  34.29 
 
 		 244 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  33.85 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  35.24 
 
 		 688 aa  98.2  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  32.67 
 
 		 671 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  35.68 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  35.38 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  36.84 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  36.46 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  33.84 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  33.81 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  33.64 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  34.63 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  30.97 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  34.63 
 
 		 688 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.26 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  34.93 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  33.64 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  36.46 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  31.31 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  35.55 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  36.7 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  33.67 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  34.16 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  37.3 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  37.11 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  34 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  36.14 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  37.31 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  40.41 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  36.46 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  35.57 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  32.86 
 
 		 220 aa  95.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  35.45 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  33.99 
 
 		 207 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  34.03 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  34.01 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  34 
 
 		 236 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  34.21 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 281 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  36.9 
 
 		 686 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  33.49 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  35.98 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  33.15 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  35.12 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  31.75 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>