More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1571 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  100 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  61.76 
 
 		 206 aa  267  8e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  61.06 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  58.12 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  52.53 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  48.86 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  49.2 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  45.74 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  46.28 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  41.44 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  39.06 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42 
 
 		 705 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.49 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.62 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  39.49 
 
 		 213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  33.17 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  40.3 
 
 		 703 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  38.76 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.39 
 
 		 686 aa  111  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  38.05 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  43.01 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  37.81 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  38.38 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  44.09 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  41.97 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  36.59 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  37.76 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  39.06 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  37.37 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  39.22 
 
 		 901 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  37.76 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  34.15 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  35.61 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  40.64 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  38.95 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  34.3 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  37.89 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  36.96 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  36.79 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 686 aa  104  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  37.11 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  38.07 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  38.19 
 
 		 688 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  39.39 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  36.1 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  37.31 
 
 		 688 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  38.17 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  37.14 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  38.86 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  37.37 
 
 		 281 aa  102  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  42.47 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  37.77 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  39.49 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  37.25 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  38.22 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  36.27 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  38.5 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  39.39 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  39.06 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  35.55 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  35.45 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  38.42 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  37.62 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  37.8 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  37.37 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  39.71 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  39.05 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  37 
 
 		 671 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  34.98 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  40.22 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 707 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  34.58 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  34.74 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  37.57 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  37.77 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  38.98 
 
 		 209 aa  97.8  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  38.92 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  34.92 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  35.2 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  37.37 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  37.06 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>