More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1246 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  100 
 
 
202 aa  411  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  45.73 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  45.85 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  43.28 
 
 
205 aa  157  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  43.39 
 
 
199 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  41.58 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  45.08 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  38.5 
 
 
209 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  42.33 
 
 
197 aa  134  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  40.56 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  36.95 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  35.92 
 
 
206 aa  124  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  39.06 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  32.49 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  35.07 
 
 
901 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  35.6 
 
 
204 aa  104  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  35.33 
 
 
203 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  33.16 
 
 
197 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  36.92 
 
 
214 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  34.91 
 
 
223 aa  101  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  34.91 
 
 
223 aa  101  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  35.58 
 
 
703 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  32.2 
 
 
205 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  34.87 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  33.18 
 
 
213 aa  99  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  35.53 
 
 
197 aa  99  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  36.46 
 
 
208 aa  99  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  33.49 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  37.06 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  32.83 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  36.63 
 
 
671 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  33.17 
 
 
705 aa  98.2  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  31.71 
 
 
208 aa  97.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  36.87 
 
 
225 aa  97.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  33.49 
 
 
217 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  33.67 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  37.25 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  33.64 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  36.27 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  32.37 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  33.64 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  36.46 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  32.85 
 
 
219 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  35.75 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  37 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  34.93 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  36.73 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  34.85 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  31.78 
 
 
212 aa  94.4  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  36.23 
 
 
230 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  35.23 
 
 
210 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  35.75 
 
 
210 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  33.8 
 
 
686 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  34.01 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  31.31 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  31.4 
 
 
707 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  36.14 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  34.29 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  33.01 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  34.5 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  34.85 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  32.68 
 
 
208 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  31.87 
 
 
212 aa  92  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  31.68 
 
 
205 aa  92  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  35.9 
 
 
210 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  31.92 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  34.17 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  31.92 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  37.56 
 
 
226 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  36.08 
 
 
200 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.98 
 
 
211 aa  91.3  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  35.27 
 
 
212 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  32.51 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  34.5 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  32.66 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  35.47 
 
 
662 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  35.9 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  33.81 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  33.33 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  34.67 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  31.66 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  35.48 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  35.94 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  32.54 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  32.51 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  29.86 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  36.05 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  32.99 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  32.55 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  31.9 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  32.07 
 
 
203 aa  89  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  35.2 
 
 
203 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  33.81 
 
 
236 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  32.65 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  30.81 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  31.6 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  31.73 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  35.52 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  33.18 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>