More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1194 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  100 
 
 		 205 aa  413  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  78.82 
 
 		 204 aa  333  7e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  76.68 
 
 		 196 aa  301  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  73.26 
 
 		 193 aa  280  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  47.85 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 218 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  43.52 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  40.64 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  40.64 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 688 aa  117  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  37.93 
 
 		 703 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  35.9 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  35.32 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  36.54 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  38.14 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  43.64 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  36.36 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  35.68 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  32.66 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  37.44 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 705 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  37.24 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  37 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  36.51 
 
 		 901 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  34.16 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 707 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  39.09 
 
 		 662 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  37.63 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  38.78 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  35.89 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  39.38 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  35.5 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  35.5 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  33.49 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  36.17 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  33.83 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  33.66 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  36.46 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  37.57 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  36.04 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  34.65 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  34.78 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  35.03 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  34.8 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  38.24 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  33 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  35.78 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  34.62 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  34.52 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  33.01 
 
 		 215 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  35.87 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  40 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  36.09 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  36.18 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  34.17 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  32.37 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  32.52 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  33.17 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  32.2 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  34.15 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  32.21 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  31.47 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  35.43 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  36.84 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  40.37 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  30.85 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  31.73 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  33.49 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  35.75 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  34.29 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  36.82 
 
 		 686 aa  98.6  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  35.87 
 
 		 281 aa  99  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  38.54 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  32.5 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  35.98 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  35.98 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  35.98 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>