More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1026 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  39.8 
 
 
207 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  42.86 
 
 
202 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  37.56 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  37.31 
 
 
202 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  37.44 
 
 
686 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36.97 
 
 
210 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  36.84 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  40.2 
 
 
204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  36.54 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  35.9 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  37 
 
 
205 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  36.23 
 
 
219 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  39.29 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  37.24 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  36.73 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  38.31 
 
 
671 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  32.47 
 
 
196 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  37.38 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  35.24 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  38.81 
 
 
686 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  33.5 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  36.73 
 
 
196 aa  108  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.47 
 
 
207 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  34.67 
 
 
199 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  38 
 
 
216 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  34.78 
 
 
213 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  35.61 
 
 
217 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  34.29 
 
 
214 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  35.05 
 
 
204 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  33.94 
 
 
217 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  34.2 
 
 
197 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  34.54 
 
 
203 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  36.08 
 
 
206 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  34.16 
 
 
201 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  35.61 
 
 
208 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  35.83 
 
 
193 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  34.2 
 
 
197 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  35.05 
 
 
901 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  36.71 
 
 
221 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  35.87 
 
 
662 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  36.84 
 
 
198 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  34.43 
 
 
220 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  34.29 
 
 
703 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  32.54 
 
 
218 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  34.45 
 
 
707 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  33.66 
 
 
243 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  34.93 
 
 
219 aa  102  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  32.86 
 
 
215 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  35.75 
 
 
210 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  32.16 
 
 
216 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  34.88 
 
 
217 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  33.18 
 
 
216 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  33.65 
 
 
222 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  31.31 
 
 
215 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  35.96 
 
 
206 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  36.23 
 
 
688 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  35.53 
 
 
217 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  34.18 
 
 
206 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  35.53 
 
 
217 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  33 
 
 
206 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  33.65 
 
 
705 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  34.55 
 
 
205 aa  99  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  32.69 
 
 
234 aa  99  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  33.8 
 
 
233 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  34.8 
 
 
206 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  34.2 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  34.8 
 
 
206 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.58 
 
 
217 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  35.05 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  34.2 
 
 
203 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  34.8 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  34.8 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  34.8 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  34.8 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  33.33 
 
 
210 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  34.8 
 
 
206 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  34.87 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  35.15 
 
 
205 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  34 
 
 
200 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  34.8 
 
 
206 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  34.54 
 
 
207 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  34.31 
 
 
206 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  34.36 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  33.64 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  33.33 
 
 
210 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  32.69 
 
 
210 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  35.05 
 
 
207 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  33.54 
 
 
203 aa  95.9  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  35.44 
 
 
211 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  33.85 
 
 
210 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  33.64 
 
 
223 aa  95.5  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  30.24 
 
 
208 aa  95.5  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  36.55 
 
 
212 aa  95.5  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  35.82 
 
 
209 aa  95.1  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  33.17 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  33.85 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  34.55 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  30.59 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  36.36 
 
 
226 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>