More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1654 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  99.08 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02846  thymidylate kinase  63.59 
 
 		 227 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  49.17 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  37.31 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  41.36 
 
 		 193 aa  113  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  35.75 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  34.85 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  38.02 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  34.17 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  36.17 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  37.37 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  32.11 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  35.71 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  38.31 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  38.37 
 
 		 688 aa  95.1  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  35.82 
 
 		 703 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  39.1 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  37.63 
 
 		 688 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  38.64 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.1 
 
 		 705 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  35.98 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  35.14 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  37.18 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  35.21 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  32.29 
 
 		 189 aa  92  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  31.55 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  37.07 
 
 		 686 aa  92  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  36.77 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  31.55 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.46 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  37.36 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 671 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  35.19 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  34.91 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  32.21 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  33.8 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  34.52 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  36 
 
 		 244 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  37.41 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  31.79 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 197 aa  88.2  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  34.39 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  36.57 
 
 		 901 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  31.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  35.58 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  32.83 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  36.42 
 
 		 686 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  32.53 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  35.84 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 707 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  36.04 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  33.99 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  31.66 
 
 		 254 aa  86.7  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  34.39 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  32.72 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  34.76 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  32.06 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  37.67 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  34.98 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  33.85 
 
 		 206 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  32.67 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  34.12 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  36.73 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  36.73 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  40.85 
 
 		 730 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  35.6 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  34.3 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  38.51 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  30.85 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  32.72 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.3 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  37.31 
 
 		 662 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  35.03 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  30.65 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  31.75 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  39.01 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  32.38 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  34.03 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  34.97 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  34.39 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  34.62 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  33.97 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  40.28 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  31.35 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>