More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0128 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  42.93 
 
 
197 aa  142  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  42.41 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.53 
 
 
197 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  39.09 
 
 
207 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40.61 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  37.37 
 
 
205 aa  125  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  44.31 
 
 
202 aa  124  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  36.59 
 
 
211 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.04 
 
 
223 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  39.3 
 
 
207 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.46 
 
 
204 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.76 
 
 
233 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40.41 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.46 
 
 
214 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  35.75 
 
 
218 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.8 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  42.51 
 
 
202 aa  118  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  38.19 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  35.9 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.1 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  38 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  34.76 
 
 
215 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  36.27 
 
 
215 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  35.96 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  34.2 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  35.03 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  41.36 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  36.59 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  35.75 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  33.81 
 
 
229 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  37.13 
 
 
211 aa  112  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  38.27 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  33.02 
 
 
213 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  35.35 
 
 
206 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  35.86 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  33.67 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  33.17 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  33.97 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  34.85 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  34.78 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  32.98 
 
 
224 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  31.44 
 
 
213 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  34.85 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  34.58 
 
 
222 aa  109  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  36.59 
 
 
217 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  33.84 
 
 
215 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  37.31 
 
 
200 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  34.31 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  34.85 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  34.85 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  34.85 
 
 
206 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  32.04 
 
 
225 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  34.85 
 
 
206 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  34.85 
 
 
206 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  38.22 
 
 
189 aa  108  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  34.36 
 
 
202 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  30.43 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  33.68 
 
 
219 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  33.16 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  35.35 
 
 
206 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  36.08 
 
 
207 aa  107  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  33.17 
 
 
219 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  33.51 
 
 
204 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  33.99 
 
 
212 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  34.67 
 
 
212 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  32.35 
 
 
224 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  34.15 
 
 
213 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  32.37 
 
 
225 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  34.63 
 
 
215 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  33 
 
 
216 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  31.82 
 
 
212 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  37.26 
 
 
219 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  37.69 
 
 
203 aa  105  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  35.68 
 
 
204 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  35.24 
 
 
215 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.72 
 
 
208 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  36.27 
 
 
216 aa  104  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  31.88 
 
 
901 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  33.17 
 
 
217 aa  104  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  34.5 
 
 
212 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  31.16 
 
 
212 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  37.04 
 
 
205 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  31.16 
 
 
212 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  36.27 
 
 
197 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  37.04 
 
 
205 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  31.48 
 
 
221 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  31.16 
 
 
212 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  36.17 
 
 
205 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  33.82 
 
 
217 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  34.17 
 
 
210 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  33.84 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  33.84 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  30.81 
 
 
212 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  33.84 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  33.84 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  33.84 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  33.84 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  33.84 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  32.69 
 
 
217 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>