More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1721 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  100 
 
 
218 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  95.54 
 
 
219 aa  352  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  95.54 
 
 
219 aa  351  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  70.39 
 
 
214 aa  250  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  48.26 
 
 
210 aa  148  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  44.98 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  42.35 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  41.03 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  42.05 
 
 
196 aa  122  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  38.29 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  42.64 
 
 
193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  36.42 
 
 
196 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  31.5 
 
 
207 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  32 
 
 
207 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2599  thymidylate kinase  34.45 
 
 
209 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  34.98 
 
 
225 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  40.46 
 
 
205 aa  102  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  34.98 
 
 
211 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  38.39 
 
 
230 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  39.02 
 
 
207 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  35.47 
 
 
202 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  36.87 
 
 
703 aa  99  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  36.95 
 
 
205 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  33 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  38.12 
 
 
901 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  36.9 
 
 
199 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  36.26 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  36.9 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  45.03 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  36.63 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.07 
 
 
705 aa  95.1  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  40 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  38.89 
 
 
206 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  36.36 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  38.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  39.8 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  37.32 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  40 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  40 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  39.44 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  40 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  37.85 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  33.01 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  36.27 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  36.32 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  33 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  37.32 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  42.22 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  38.76 
 
 
209 aa  92  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  29.19 
 
 
207 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  40.33 
 
 
230 aa  92  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  38.89 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  34.34 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  35.02 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  34.62 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  36.79 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.35 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  38.03 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  37.5 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  40.67 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  36.32 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  36.02 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  36.41 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  34.3 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  34.3 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  37.74 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  40 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  41.89 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  33.17 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  35.47 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  34.62 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  34 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  42.94 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  38.89 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  38.1 
 
 
230 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  39.59 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  31.03 
 
 
206 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  34.87 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  45.89 
 
 
662 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  33.13 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  37.86 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33.74 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  34.15 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40.4 
 
 
686 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  33.13 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  31.1 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  36.36 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  38.95 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  33.97 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  34.64 
 
 
207 aa  85.1  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  37.56 
 
 
215 aa  84.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  36.19 
 
 
200 aa  84.7  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>