More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0288 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  97.99 
 
 
199 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  93.97 
 
 
199 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  70.2 
 
 
198 aa  289  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  55.15 
 
 
196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  38.97 
 
 
193 aa  122  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  38.55 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  34.69 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  35.2 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  36.79 
 
 
200 aa  105  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  35.78 
 
 
205 aa  104  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  36.9 
 
 
218 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  33.01 
 
 
210 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  34.95 
 
 
197 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  37.35 
 
 
219 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  37.35 
 
 
219 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  37.02 
 
 
189 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  35.94 
 
 
196 aa  102  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  37.5 
 
 
254 aa  101  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2599  thymidylate kinase  34.6 
 
 
209 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  33.51 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  36.18 
 
 
686 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  34.43 
 
 
219 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  35.68 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  37.14 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  38.69 
 
 
203 aa  95.1  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  31.02 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  35.63 
 
 
234 aa  94.7  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  35.29 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  32.57 
 
 
217 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  34.18 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  31.19 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  32 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  32 
 
 
207 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  35.86 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  38 
 
 
200 aa  91.3  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  33.71 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  29.46 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  29.17 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  34.67 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  32.08 
 
 
707 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  31.96 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  29.33 
 
 
281 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  33.52 
 
 
213 aa  89  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  36.14 
 
 
202 aa  89  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  33.9 
 
 
686 aa  88.6  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  33.71 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  28.98 
 
 
222 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  33.49 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  33.49 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  32.37 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  30.37 
 
 
703 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  28.97 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  29.91 
 
 
705 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  33.01 
 
 
206 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.73 
 
 
688 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  33.15 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  33.49 
 
 
671 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  32.54 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  35.39 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  36.97 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  32.49 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  32.49 
 
 
197 aa  87  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  32.54 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  31.6 
 
 
209 aa  87  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  32.54 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  33.17 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  36.84 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  36.36 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  31.6 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  37.16 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  32.84 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  38.89 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  30.73 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  29.13 
 
 
215 aa  84.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  31.89 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  30.52 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  33.18 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  28.28 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  32.02 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  38.24 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  32.7 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  40.44 
 
 
662 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  32.16 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  29.25 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  32.16 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  31.25 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  31.25 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  32.16 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  39.1 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  32.16 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  32.16 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  32.16 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  32.16 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  33.89 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  29.33 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  32.72 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.84 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  37.5 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  35.95 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>