More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2063 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  58.59 
 
 		 206 aa  251  8.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  63.49 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  54.64 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  45.31 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  41.09 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  45.86 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  38.5 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  43.41 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  41.76 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  38.74 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  40.22 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  40.31 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  39.34 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  37.07 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  38.28 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  40 
 
 		 688 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  33.97 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  39.27 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  38.83 
 
 		 221 aa  111  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  39.27 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 705 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  31.5 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  35.48 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.45 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.39 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  38.39 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  39.38 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  37.91 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  36.97 
 
 		 222 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  38.58 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  39.46 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  37.91 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  36.27 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  39.2 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  35.91 
 
 		 703 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  36.55 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  33.67 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  37.69 
 
 		 243 aa  104  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  38.38 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  35.96 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  35.61 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  35.78 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  34.62 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  38.38 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  35.89 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  38.5 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  32.88 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  36.98 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  38.54 
 
 		 244 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  39.06 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 281 aa  101  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  33.65 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  34.45 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  37.06 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  37.7 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  33.68 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  34.8 
 
 		 688 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  37.37 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  32.26 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  36.76 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  35.83 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  35.12 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  36.46 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  34.11 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  36.59 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  34.41 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  32.68 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  37.37 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  36.59 
 
 		 686 aa  98.2  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  35.47 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  37.95 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  35.11 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  34.58 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  35.38 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  34.74 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  32.16 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  32.2 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  36.08 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  38.34 
 
 		 901 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  37.63 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  38.17 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  35.78 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  29.15 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  34.18 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>