More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0636 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  100 
 
 		 228 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  36.32 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  29.83 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  29.82 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  31.08 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  30.94 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  31.08 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  27.35 
 
 		 328 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  32.98 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  35.45 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  38 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  33.68 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  34.9 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  30.48 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  32.98 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  31.05 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  31.28 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  30.46 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  32.74 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  31.98 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  34.04 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  33.95 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  38.36 
 
 		 730 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  33.94 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  33 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  26.91 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.76 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  33.33 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  30.36 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  31.76 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  34.03 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  32.47 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  33.54 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  33.1 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  31.49 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  34.55 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  29.33 
 
 		 688 aa  66.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  31.65 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  28.44 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  29.14 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  36.67 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  28.12 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  34.66 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  29.79 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  34.03 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  29.94 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  30.3 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  29.02 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  31.52 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  29.09 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  30.05 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  27.31 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  27.4 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  31.93 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  31.68 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  27.31 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  31.45 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  27.31 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  31.58 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  29.47 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  27.23 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  28.63 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  29.26 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  28.19 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  34.62 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  27.6 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  27.4 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  34.23 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  31.11 
 
 		 703 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  28.37 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  25.85 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  27.4 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  27.4 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  28.36 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  33.11 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  26.75 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  26.09 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  28.66 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.48 
 
 		 901 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  26.75 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  26.48 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  32.05 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  32.67 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  28.7 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  29.68 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  29.67 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  31.52 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  29.14 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  32.93 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>