218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1096 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  54.13 
 
 
227 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  50.68 
 
 
225 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  50.93 
 
 
227 aa  222  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  49.33 
 
 
223 aa  218  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  30.91 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  30.94 
 
 
228 aa  98.6  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  29.78 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  32.73 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  33.02 
 
 
193 aa  86.7  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  30.06 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  29.06 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  31.37 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  32.65 
 
 
210 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  30.07 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  31.97 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  30.61 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  31.97 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  25.87 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  30 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  28.38 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  25.51 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  25.51 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  26.85 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  26.9 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  28.67 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  34.15 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  26.78 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  26.2 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  27.07 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  28.76 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  26.83 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  24.84 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  27.39 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  25.23 
 
 
197 aa  62  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  27.23 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.29 
 
 
707 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  28.12 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  27.54 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  27.92 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  28.83 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  23.64 
 
 
686 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  27.1 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  25 
 
 
901 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  22.77 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  26.44 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  25.66 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  25.71 
 
 
703 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  26.7 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0020  thymidylate kinase  29.45 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  26.52 
 
 
686 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  28.78 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  22.22 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  27.15 
 
 
688 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  27.67 
 
 
205 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  26.73 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  24.54 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  24.18 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  23.38 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  23.65 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  26.88 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  21.25 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  25.33 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  26.97 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  26.58 
 
 
705 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  23.81 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  24.12 
 
 
671 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  28.4 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  25.17 
 
 
662 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  26.91 
 
 
254 aa  55.5  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  22.7 
 
 
217 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  26.73 
 
 
212 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  23.87 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  27.54 
 
 
196 aa  55.1  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  19.74 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  27.63 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  28.92 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  21.34 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  20.85 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  27.5 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  25 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  23.46 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  23.19 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  22.73 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  26.8 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  22.92 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  26.48 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  22.81 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  21.74 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  24.24 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  26.8 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  22.08 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  20.89 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  25 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  22.12 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  24.56 
 
 
209 aa  52.8  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  22.12 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  26.51 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  22.56 
 
 
688 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  25.95 
 
 
217 aa  52.4  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>