More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2209 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  34.26 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  35.24 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  36.32 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  34.82 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  32.46 
 
 		 328 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  30.91 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  32.88 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  35.03 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  31.63 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  33.84 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  34.85 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  36.49 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  35.66 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  33.84 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  35.92 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  35.16 
 
 		 703 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  35.21 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  34.25 
 
 		 705 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  30.81 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  28.89 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  30.48 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  32.77 
 
 		 730 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  30.53 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  26.42 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  29.61 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  30.3 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  30.04 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  29.61 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  31.37 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  29.17 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  29 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  30.73 
 
 		 707 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  29.29 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  29 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  31.47 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  30.41 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  30.59 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  32.68 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  27.9 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  33.54 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  32.99 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  34.15 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  31.47 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  32.83 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  28.57 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  30.68 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  27.56 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  29.91 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  30.26 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  28.21 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  34.01 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  30.4 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  28.18 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  27.83 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  30.37 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  26.09 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  28.51 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  31.13 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  34.42 
 
 		 709 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  27.89 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  27.92 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  28.51 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  30.46 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  35.19 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  34.86 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  29.38 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  31.79 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  27.01 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  30.46 
 
 		 688 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  29.52 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  26.5 
 
 		 901 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  29.14 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  26.73 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  32.65 
 
 		 686 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  35.96 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  29.17 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  26.75 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 671 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  29.55 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  28.18 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  28.43 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  28.49 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0020  thymidylate kinase  27.78 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  27.32 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  30.5 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.24 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  28.65 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  28.38 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  28.25 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  32.32 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  27.19 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  30.82 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>