72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4251 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  56.44 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  51.76 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  54.95 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  54.19 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  54.07 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  53.57 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  50.52 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  31.48 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  33.84 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  29.19 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  32.73 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  30.94 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  31.28 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  32.93 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  23.87 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  35.64 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  27.89 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  27 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  34.41 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  31.35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  34.41 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  34.2 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  31.22 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  32.14 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  28.17 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  30.16 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  30.57 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0823  thymidylate kinase  21.88 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.142499  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  24.1 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  33.14 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  29.1 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  31.58 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  26.46 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.71 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  31.75 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  26.79 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  30 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  26.54 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  30.43 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  33.89 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  27.96 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  27.75 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  30.16 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  31.74 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  33.33 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  25.13 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  27.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  27.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  27.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  28.87 
 
 		 207 aa  42  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  29.8 
 
 		 227 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  28.21 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02510  Thymidylate kinase  34.03 
 
 		 189 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  27.46 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  27.46 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  27.46 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  28.42 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  36.19 
 
 		 234 aa  41.6  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2823  thymidylate kinase-like protein  34.78 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  31.69 
 
 		 703 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  25.13 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>