77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1380 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  100 
 
 
229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  98.69 
 
 
229 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  98.1 
 
 
210 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  76.67 
 
 
211 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  75.98 
 
 
209 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  66.18 
 
 
214 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  59.9 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  65.26 
 
 
211 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  54.19 
 
 
213 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  57 
 
 
213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  55.78 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  48.21 
 
 
241 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  45.64 
 
 
212 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  31.16 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  33.33 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  29.74 
 
 
232 aa  88.6  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  27.62 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  26.83 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  26.32 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  28.09 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  29.94 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  26.94 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  30.32 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  28.85 
 
 
189 aa  55.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  31.77 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  28.43 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  27.69 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  35.03 
 
 
213 aa  52  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  26.39 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  30.05 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  32.63 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  28.57 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  29.12 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  29.45 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  28.21 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  30.64 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.63 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  28.57 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  26.46 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  28.19 
 
 
206 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  33.56 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  35.59 
 
 
229 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  31.65 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  25.79 
 
 
198 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  32.54 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  26.58 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  29.7 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  30.21 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  30 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  27.92 
 
 
196 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  29.41 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  30.2 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  29.15 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  32.74 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  28.26 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  29.65 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  33.65 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  29.41 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  30.49 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  29.11 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  25.97 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  28.95 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  33.5 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  27.01 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  33.33 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  31.03 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  26.67 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  34.29 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  29.95 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  32.14 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  32.48 
 
 
324 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  29.8 
 
 
227 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  36.07 
 
 
222 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  32.03 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  25.62 
 
 
211 aa  42  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  34.64 
 
 
197 aa  41.6  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  31.64 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>