216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3015 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  100 
 
 		 225 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 227 aa  255  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  52.56 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  50.68 
 
 		 232 aa  231  9e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  52.31 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  34.82 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  31.08 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  26.36 
 
 		 328 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  30.94 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  31.25 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  31.79 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  28.16 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  26.96 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  31.35 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  29.31 
 
 		 705 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  24.14 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  29.89 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  28 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 707 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  28.74 
 
 		 703 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  27.91 
 
 		 688 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  26.01 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  29.21 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  29.28 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  27.17 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  29.31 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  28.09 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  27.53 
 
 		 686 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  28.09 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  25.67 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  27.95 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  24.88 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  28.09 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  29.75 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  23.92 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  25.89 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  22.62 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  26.25 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  26.21 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  25.82 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  28.8 
 
 		 688 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  26.53 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  25.95 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  26.17 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  24.5 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  23.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  29.53 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  27.54 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  26.11 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  26.44 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  26.11 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  24.12 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  25.23 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  26.26 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  25.89 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  23.42 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  28.66 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  23.61 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  25.88 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  29.45 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  27.45 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  27.4 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  28 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  23.71 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  23.14 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  24.02 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  26.67 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  25.85 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  26.11 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  26.27 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  25.85 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  27.63 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  26.32 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  24.12 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  25.37 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  24.46 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  26.92 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  24.7 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  27.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  28.32 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  23.59 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  33.11 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  22.75 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5614  thymidylate kinase  29.14 
 
 		 572 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  28.43 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  25.95 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  24.83 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  25.15 
 
 		 901 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  25.89 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  26.05 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  21.12 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  23.47 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  32.43 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  33.33 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  25.16 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  26.71 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  23.12 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  27.89 
 
 		 662 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>