249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  66.49 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  62.18 
 
 		 211 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  60.1 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  60.42 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  60.42 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  59.9 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  62.05 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  53.89 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  57.58 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  45.92 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  32.88 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  30 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  27.53 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  32.98 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  30.06 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  25.93 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  28.16 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  25 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  36.32 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  35.42 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  33.12 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  27.94 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  34.9 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  38.38 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  29.1 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  30.46 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  30.72 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  30.88 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  31.86 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  30.52 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  29.14 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  32.69 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  27.96 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  28.5 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  32.8 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  33.84 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  34.81 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  30.73 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  30.19 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  28.22 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  36.59 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  29.95 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.77 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  27.01 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.36 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  35.06 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  32.06 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  27.98 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  34.57 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  31.77 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02510  Thymidylate kinase  34.97 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  33.97 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  27.74 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  32.89 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  32.76 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  31.37 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  34.97 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  35 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  32.9 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  34.08 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  29.63 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  30.57 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  35.26 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  28.36 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  27.78 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  26.16 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  31.39 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  36.36 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  25.88 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  30.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  32.05 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  26.15 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  29.39 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  30.32 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  27.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  35.39 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  30.81 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  30.85 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  27.14 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  34.29 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  27.22 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  28.4 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>