75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1364 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  100 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  98.69 
 
 		 229 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  99.52 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  76.19 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  75.49 
 
 		 209 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  65.7 
 
 		 214 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  60.42 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  65.26 
 
 		 211 aa  205  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  57.49 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  56.28 
 
 		 210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  48.21 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  31.66 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  27.62 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  26.83 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  26.32 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  28.09 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  29.31 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  26.42 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  31.22 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  28.85 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  28.43 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  35.56 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  31.77 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  30.73 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  26.39 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  27.18 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  31.21 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  28 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  31.79 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  32.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  25.13 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  32.26 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  29.3 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  28 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  26.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  28.72 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  28.21 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  29.69 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  33.56 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  27.87 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  29.33 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  27.98 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  27.64 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  32.54 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  34.75 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  32.76 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.01 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  30 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  31.33 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  30.49 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  29.15 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  30.21 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  29.24 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  29.11 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  27.75 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  35.24 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  26.37 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  32.74 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  28.82 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  32.69 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  25.62 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  28.82 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  33.55 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  25.26 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  36.07 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  29.95 
 
 		 224 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 219 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  26.44 
 
 		 218 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  32.76 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>