234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1707 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  32.18 
 
 
245 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  33.16 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  27.89 
 
 
218 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  29.08 
 
 
217 aa  88.2  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  33.02 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  30.61 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  27.46 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  27.69 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  26.42 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  28.77 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  28.77 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  28.43 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  28.1 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  32.18 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  25.52 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  31.91 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  25.26 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  26.73 
 
 
281 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  25 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  29.85 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  29.61 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  34.29 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  26.01 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  33.52 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  29.65 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  26.73 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  27.69 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  26.42 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  25.13 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  25.93 
 
 
328 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  29.29 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  23.76 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  24.26 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  25.91 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  29.8 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  28.43 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  26.42 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  24.75 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  29.79 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  27.67 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  26.77 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  29.44 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  27.32 
 
 
225 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  25.37 
 
 
213 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  25 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  31.38 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  25.38 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  26.98 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  28.1 
 
 
214 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  22 
 
 
210 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  27.83 
 
 
219 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  31.16 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  26.7 
 
 
227 aa  61.6  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  25 
 
 
211 aa  61.2  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  27.55 
 
 
217 aa  61.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  30.05 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  23.83 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  26.37 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  25.65 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  27.78 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1920  thymidylate kinase  25.89 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  27.55 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  29 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  27.41 
 
 
688 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  25.73 
 
 
705 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  26.21 
 
 
703 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  30.41 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  25.24 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  26.63 
 
 
901 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  30.65 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  26.89 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  24.64 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  29.9 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  26.29 
 
 
707 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  30.5 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0020  thymidylate kinase  26.5 
 
 
229 aa  58.2  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  28.93 
 
 
220 aa  58.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  25.26 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  27.36 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  25.74 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  29.59 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  24 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  25.62 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  25.5 
 
 
207 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  28.72 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  26.51 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  29.15 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  30.05 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  24.04 
 
 
209 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  25.62 
 
 
213 aa  55.1  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  24.26 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  27 
 
 
213 aa  54.7  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  25.95 
 
 
221 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  25.4 
 
 
240 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  28.95 
 
 
199 aa  54.7  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  28.79 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  28.43 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  25.73 
 
 
216 aa  54.7  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  29.29 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>