290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2567 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  88.05 
 
 		 226 aa  410  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  41.54 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  39.71 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  40 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2162  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2161  thymidylate kinase related protein  29.41 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0979  thymidylate kinase-like protein  33.97 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.382575  normal  0.0661635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  30.72 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  31.43 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  30.14 
 
 		 901 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  31.91 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  27.06 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  32.14 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  32.43 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  28.37 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  25.35 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  32.87 
 
 		 707 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  30.25 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  25 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  25.35 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  24.3 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  26.29 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  26.57 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  34.04 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  25.46 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  25.23 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  24.77 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  28.04 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  33.86 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  30.72 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  27.23 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  32.39 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  30.07 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  31.13 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  31.72 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  24.29 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  26.76 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  28.25 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  28.82 
 
 		 705 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  30.72 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  30.94 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  31.79 
 
 		 688 aa  61.6  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  26.64 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  25.93 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  31.69 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  28.86 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  32.88 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  30.46 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  25.35 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  30.57 
 
 		 730 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  31.97 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  32.03 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.52 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  31.58 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  24.4 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  32.41 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  34.72 
 
 		 686 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  29.29 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  31.76 
 
 		 662 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  26.7 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  27.23 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  26.41 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  28.11 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  30.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  26.2 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  29.68 
 
 		 707 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  23.44 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  30.82 
 
 		 686 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  27.39 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  25.57 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  31.33 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  30.48 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  33.06 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  29.53 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5614  thymidylate kinase  34.31 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  30.48 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  30.95 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  31.25 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  33.13 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  27.71 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  28.86 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  31.15 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  27.95 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  29.49 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  26.58 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  25.11 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  32.58 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  27.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  30.6 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  25.99 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  30.82 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  29.5 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  34.56 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  30.43 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  29.5 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>