More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5614 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5614  thymidylate kinase  100 
 
 		 572 aa  1130    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3375  dTMP kinase  40 
 
 		 564 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.338417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3313  thymidylate kinase  38.75 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.395384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3393  thymidylate kinase  38.62 
 
 		 567 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3457  thymidylate kinase  38.32 
 
 		 567 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.109467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.26 
 
 		 207 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  35.45 
 
 		 212 aa  113  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  32.49 
 
 		 222 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  34.8 
 
 		 224 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  33.16 
 
 		 225 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  32.88 
 
 		 214 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  34.82 
 
 		 226 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  34.84 
 
 		 229 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  32.7 
 
 		 211 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  37.33 
 
 		 707 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  33.49 
 
 		 236 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  35.68 
 
 		 217 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  33.84 
 
 		 219 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  37.06 
 
 		 210 aa  103  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  35.9 
 
 		 215 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  35.53 
 
 		 213 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  34.17 
 
 		 213 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  34.53 
 
 		 210 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  33.49 
 
 		 216 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  31.96 
 
 		 210 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  33.51 
 
 		 232 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  33.85 
 
 		 219 aa  98.6  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 215 aa  98.2  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  36.36 
 
 		 207 aa  97.4  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  31.84 
 
 		 213 aa  97.4  6e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  34.23 
 
 		 207 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  29.17 
 
 		 217 aa  97.4  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  31.63 
 
 		 208 aa  97.1  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  32.09 
 
 		 207 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 212 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  35.05 
 
 		 222 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  33.8 
 
 		 210 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 207 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  29.68 
 
 		 209 aa  95.9  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  33.85 
 
 		 217 aa  95.9  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  30.41 
 
 		 203 aa  96.3  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  34.85 
 
 		 703 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  30.18 
 
 		 210 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  30.5 
 
 		 214 aa  94.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 234 aa  94.7  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  32.65 
 
 		 206 aa  94.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 217 aa  94  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  36.22 
 
 		 222 aa  93.6  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  31.31 
 
 		 207 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  32.52 
 
 		 705 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  36.22 
 
 		 221 aa  93.2  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 210 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 210 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  35.53 
 
 		 210 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  36.04 
 
 		 210 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  36.15 
 
 		 688 aa  92.8  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 206 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  27.11 
 
 		 211 aa  90.9  6e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  31.79 
 
 		 671 aa  90.5  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  30.73 
 
 		 211 aa  90.5  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  32.86 
 
 		 210 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  30.22 
 
 		 211 aa  90.1  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  35.38 
 
 		 686 aa  90.1  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 206 aa  90.1  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  31.96 
 
 		 226 aa  90.1  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  29.29 
 
 		 217 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 901 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 206 aa  89.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  32.31 
 
 		 197 aa  89.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  35.86 
 
 		 212 aa  89.7  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  34.01 
 
 		 209 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  34.74 
 
 		 707 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  30.91 
 
 		 234 aa  89  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  33.48 
 
 		 217 aa  89.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  30.04 
 
 		 210 aa  88.6  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  32.83 
 
 		 216 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  34 
 
 		 223 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 244 aa  88.2  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  34 
 
 		 223 aa  87.8  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  33.33 
 
 		 216 aa  87.8  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 208 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  36.68 
 
 		 225 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  36.1 
 
 		 662 aa  87.4  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  31.08 
 
 		 223 aa  87.4  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  34.12 
 
 		 686 aa  87.4  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 208 aa  87  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  32.57 
 
 		 213 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  36.68 
 
 		 225 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  32.65 
 
 		 214 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  34.62 
 
 		 219 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  31.53 
 
 		 212 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 213 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  32.63 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  30.93 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>