More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3457 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3313  thymidylate kinase  88.54 
 
 		 561 aa  778    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.395384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3393  thymidylate kinase  98.77 
 
 		 567 aa  1018    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3457  thymidylate kinase  100 
 
 		 567 aa  1032    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.109467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3375  dTMP kinase  65.31 
 
 		 564 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.338417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5614  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 572 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37.79 
 
 		 901 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  50.36 
 
 		 662 aa  104  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  39.63 
 
 		 213 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.38 
 
 		 688 aa  100  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 705 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  39.44 
 
 		 703 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  39.79 
 
 		 688 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  41.07 
 
 		 206 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  41.07 
 
 		 206 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  41.07 
 
 		 206 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  41.07 
 
 		 206 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 707 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 206 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  29.25 
 
 		 211 aa  94.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 206 aa  94  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  30.54 
 
 		 206 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  32.42 
 
 		 219 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  33.63 
 
 		 215 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  40.54 
 
 		 206 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  37.7 
 
 		 686 aa  92  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  42.47 
 
 		 213 aa  92  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  36.04 
 
 		 217 aa  90.5  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  34.65 
 
 		 671 aa  90.1  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  30.41 
 
 		 207 aa  90.1  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 206 aa  90.1  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  39.86 
 
 		 206 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  36.6 
 
 		 224 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36.74 
 
 		 210 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 210 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 209 aa  88.2  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  37.67 
 
 		 197 aa  88.6  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  40.21 
 
 		 224 aa  87.8  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  36.9 
 
 		 217 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  35.29 
 
 		 199 aa  87.4  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  32.46 
 
 		 207 aa  87  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  35.75 
 
 		 212 aa  87.4  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  31.64 
 
 		 215 aa  87  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  36.55 
 
 		 214 aa  87  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 210 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  31.41 
 
 		 207 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  35.24 
 
 		 222 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  36.11 
 
 		 219 aa  85.9  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 206 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  34 
 
 		 210 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  38.03 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  36.97 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  35.37 
 
 		 730 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  33.79 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  41.91 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  34.31 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  28.18 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  34.25 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  32.38 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  34.46 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  37.16 
 
 		 216 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  31.61 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  29.32 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  35.87 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  38.1 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  33.64 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  31.16 
 
 		 223 aa  79.7  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  38.99 
 
 		 202 aa  80.1  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  36.3 
 
 		 216 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  32.23 
 
 		 229 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 226 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  34.53 
 
 		 213 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 210 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  36.94 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  32.86 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  35.17 
 
 		 197 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  35.21 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  31.75 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  31.48 
 
 		 209 aa  79.3  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  34.26 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  39.04 
 
 		 204 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  37.58 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  35.42 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  31.97 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  33.09 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  31.58 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>