154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2161 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2161  thymidylate kinase related protein  100 
 
 		 205 aa  413  9.999999999999999e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0979  thymidylate kinase-like protein  57.65 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.382575  normal  0.0661635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  30.88 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2162  thymidylate kinase  30.39 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  28.43 
 
 		 213 aa  88.6  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  27.16 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  24.62 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  26.58 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  25.23 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  31.53 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  25.13 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  33.62 
 
 		 671 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  26.14 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  25.82 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  28.04 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  26.24 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  24.27 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  32.12 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  31.62 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  25.99 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  28.95 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  26.29 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  24.73 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  33.04 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.19 
 
 		 688 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  26.32 
 
 		 688 aa  52  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  27.21 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  25.45 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  20.95 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  23.58 
 
 		 705 aa  51.2  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  26.19 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  23.88 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  24.55 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  31.09 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  26.95 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.57 
 
 		 686 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 686 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  25.7 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  25.71 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  23.84 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  23.96 
 
 		 703 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  24.77 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  27.67 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  27.36 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  30.21 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  27.12 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  26.9 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  24.77 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  24.88 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  25.56 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  31.86 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  24.06 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  24.06 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  24.06 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  22.61 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  24.06 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  24.06 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  23.74 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  23.74 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  24.88 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  23.74 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  23.74 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  27.21 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  23.74 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  23.74 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  23.74 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  23.74 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  24.67 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  23.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  32.5 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  21.53 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  27.01 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  25.45 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  29.73 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  29.73 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  22.52 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  26.7 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  23.84 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  26.49 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  27.27 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  31.4 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  24.74 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  27.45 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3375  dTMP kinase  27.97 
 
 		 564 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.338417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  23.84 
 
 		 730 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  22.77 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  23.7 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  26.27 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  25.12 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  26.67 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  22.17 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  26.73 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  22.8 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  28.21 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  30.61 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  27.36 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  23.7 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  25.24 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>