More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2643 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  83.26 
 
 		 228 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2162  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  45.15 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  41.33 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  27.73 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  38.36 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  33.1 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  27.36 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  31.16 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  34.85 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  30.84 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  27.18 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  30.52 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  31.13 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  34.87 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  28.7 
 
 		 730 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  37.14 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  34.06 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  32.57 
 
 		 688 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  29.9 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0979  thymidylate kinase-like protein  26.55 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.382575  normal  0.0661635 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2161  thymidylate kinase related protein  24.62 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  27.27 
 
 		 707 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.72 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  36.77 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  25.59 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  29.63 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  28.64 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  24.43 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  27.7 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  36.55 
 
 		 901 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  27.98 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  30.41 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  29.03 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  28.67 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  29.5 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  29.68 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  30.5 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  29.72 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  27.75 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  27.85 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.5 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  29 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  29.56 
 
 		 197 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  30.73 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  28.64 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  29.93 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  25.24 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  33.56 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  27.08 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  28.77 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  30.94 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  33.56 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  30.54 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  30.61 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  31.02 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  29.91 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  34.84 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.89 
 
 		 707 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  30 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  28.38 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  28.64 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  29.91 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  28.44 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  33.11 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  32 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  28.3 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  29 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  30.24 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  33.1 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  31.72 
 
 		 209 aa  62  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  31.08 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  29.72 
 
 		 686 aa  61.6  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  32.87 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  30.34 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  36.13 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  32.47 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  32.47 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  25.57 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  32.47 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  31.25 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  30.82 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  32 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  31.07 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  27.93 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  28.34 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  30.3 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  34.64 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  34.23 
 
 		 688 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  28.93 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  27.7 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>