More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2162 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2162  thymidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  66.51 
 
 		 213 aa  299  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  46.23 
 
 		 228 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  44.08 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  29.25 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  29.58 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2161  thymidylate kinase related protein  30.39 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0979  thymidylate kinase-like protein  28.37 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.382575  normal  0.0661635 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  32.37 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  29.21 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  33.33 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  28.99 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  28.44 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  30.32 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  31.46 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  28.77 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  31.22 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  27.11 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  30.43 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  30.09 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  33.02 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  28.44 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  28.08 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  25.49 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  27.73 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  27.73 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  34.93 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  32 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  28.16 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  31.65 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.65 
 
 		 730 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  25 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  26.73 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  24.42 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.9 
 
 		 686 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  29.05 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  27.6 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  25.37 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  26.13 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  27 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  29.08 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  28.17 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  31.97 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  28.7 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  31.12 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  30.29 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  26.82 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  28.17 
 
 		 901 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  32.09 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  30.96 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  25.35 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  24.2 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  25.68 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  25.34 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  23.89 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  26.09 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  27.6 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  35.14 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  25.35 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  25.73 
 
 		 707 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  24.42 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  30.61 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  29.21 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  28.7 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  24.42 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  28.64 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  29.66 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  30.48 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  32.41 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  23.61 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  25.56 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  24.3 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  26.67 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  29.93 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  21.46 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  26.89 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  25.48 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  28.02 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  23.42 
 
 		 671 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  27.35 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  26.03 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  25.74 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  29.35 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  23.77 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.41 
 
 		 688 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  27.31 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  29.3 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  26.92 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  26.92 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  26.92 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  26.92 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  26.92 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  26.92 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  24.56 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>