95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2513 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  34.51 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  27.73 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  35.66 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2162  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  31.21 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  28 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  32.67 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  27.8 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  26.8 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  31.02 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  27.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  27.45 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  27.59 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  28.99 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  27.06 
 
 		 688 aa  52  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  27.81 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  25.64 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  25.97 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  23.98 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  23.17 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  30.61 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  24.38 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  24.38 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  25.88 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  25.64 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  32.08 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  23.98 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  31.31 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  31.45 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  25.69 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  27.37 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  28.5 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  28.97 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  26.34 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  24.7 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  24.7 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  27.85 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  23.53 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  24.7 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  24.7 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2353  thymidylate kinase  28.86 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  28.48 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  24.7 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  23.08 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  24.45 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  23.08 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  23.19 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  23.42 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  25.44 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  25.85 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  24.53 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  28.19 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  25 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  24.86 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  26.28 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  25.64 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  27.66 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  27.36 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  22.77 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  28.76 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2161  thymidylate kinase related protein  30.61 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  24.21 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  23.21 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  25.83 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  27.92 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  25.34 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  26.19 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  26.84 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  23.53 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  24.32 
 
 		 686 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  29.29 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  26.74 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  30.2 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  25 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  28.03 
 
 		 703 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  20.91 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  21.46 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  28.29 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  28.77 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  22.42 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  22.78 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  29.14 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  22.29 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  29.66 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  24.83 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  23.68 
 
 		 212 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  28.39 
 
 		 197 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  22.02 
 
 		 213 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  20.45 
 
 		 208 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  20.45 
 
 		 208 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  20.45 
 
 		 208 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  23.04 
 
 		 686 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>