237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53211 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  100 
 
 		 229 aa  460  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  40.52 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  37.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  40.11 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  38.01 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  33.33 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  35.32 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  32.39 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  29.11 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  26.17 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1126  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  31.35 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  28.82 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  28.51 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  29.06 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  28 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  26.54 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  26.54 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  32.26 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  38 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  31.47 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  27.67 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  29.15 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  26.67 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  27.31 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  25.45 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  28.7 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  32.45 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  27.31 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  36 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  38 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  28.88 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  27.83 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1271  thymidylate kinase  40 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2599  thymidylate kinase  35.85 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  26.01 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  28.83 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0924  thymidylate kinase  37.76 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  27.23 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  28.02 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  25.69 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  25.79 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  27.68 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  27.73 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  38 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  28.07 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  28.7 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  29.26 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  27.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  26.7 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  27.88 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  30.28 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1246  thymidylate kinase  35.79 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0268379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  29.02 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  28.25 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  39.39 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  28.7 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  28.09 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  29.28 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  24.44 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0787  thymidylate kinase  34.74 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0204299  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  28.7 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  27.83 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  27.6 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  28.18 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  27.45 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  37.96 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  28.17 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  26.92 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.25 
 
 		 707 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  25.83 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0857  thymidylate kinase  34.74 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  31.36 
 
 		 686 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.55 
 
 		 901 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  32.69 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  27.12 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 730 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  37.14 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  29.35 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0893  thymidylate kinase  34.34 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.298263  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  27.89 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  27.32 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  31.38 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  26.94 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  32.7 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  30.09 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  26.72 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  32.42 
 
 		 688 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  27.78 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  29.19 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  33.33 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  28.14 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  26.87 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1287  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.310287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  27.81 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  35.29 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>