More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1287 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1287  thymidylate kinase  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.310287  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1271  thymidylate kinase  43.3 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1246  thymidylate kinase  43.65 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0268379  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0787  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0204299  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0857  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 192 aa  157  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0893  thymidylate kinase  43.01 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.298263  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0924  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0744  thymidylate kinase  41.92 
 
 		 194 aa  144  9e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.164492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1126  thymidylate kinase  40.72 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  34 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  32 
 
 		 213 aa  88.2  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  32.52 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.99 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  34.52 
 
 		 688 aa  86.3  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  30.65 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  30.88 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  30.15 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  30 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  33.5 
 
 		 703 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  30.59 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  29.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  30.88 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  29.27 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  30.3 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  30.92 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  30.58 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  30.88 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  28.43 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  31.25 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  30.21 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  32.83 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  27.94 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  33.5 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  32.49 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.1 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  30.39 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  29.8 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  29.76 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  31.25 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  30.61 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  30.35 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.83 
 
 		 730 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  31.25 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  30.3 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  30.35 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  31.73 
 
 		 705 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  35.48 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  28.64 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  30.54 
 
 		 686 aa  72.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  29.29 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  30.39 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  32.35 
 
 		 688 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  39.47 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  31.12 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  27 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  30 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  26.63 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  29.65 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  32.57 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  28.72 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  29.7 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  29.8 
 
 		 901 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  28.86 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  27.72 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  28.92 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  39.42 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  35.66 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  37.9 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  29.33 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  28.36 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  26.77 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  28.29 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  28.77 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  38.33 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  35.34 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  30.1 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  28.02 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  29.94 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  29.7 
 
 		 707 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  27.78 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  33.83 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  29.69 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  29.35 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  29.35 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  29.33 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  29.02 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  28.86 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  34.91 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>