More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1271 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1271  thymidylate kinase  100 
 
 
195 aa  379  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  63.92 
 
 
194 aa  249  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0893  thymidylate kinase  53.65 
 
 
192 aa  205  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.298263  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0924  thymidylate kinase  55.15 
 
 
195 aa  186  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1246  thymidylate kinase  50.76 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0268379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0857  thymidylate kinase  49.75 
 
 
192 aa  174  7e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0787  thymidylate kinase  49.75 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0204299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1126  thymidylate kinase  50.26 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0744  thymidylate kinase  48.73 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.164492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1287  thymidylate kinase  43.3 
 
 
194 aa  170  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.310287  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  34.62 
 
 
206 aa  106  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  34.17 
 
 
197 aa  104  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  35.18 
 
 
199 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  33.17 
 
 
209 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  32.67 
 
 
234 aa  101  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  31.84 
 
 
211 aa  101  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  34.6 
 
 
215 aa  101  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  32.32 
 
 
212 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  35.15 
 
 
213 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  28.85 
 
 
215 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  33.99 
 
 
225 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  34.67 
 
 
207 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  32.34 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  30.81 
 
 
212 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  31.34 
 
 
730 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  28.21 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  32.49 
 
 
686 aa  95.9  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  35.32 
 
 
215 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  29.65 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  30.93 
 
 
224 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  33.16 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  36.81 
 
 
243 aa  92.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  31.73 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  34.76 
 
 
688 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  33.33 
 
 
686 aa  91.7  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  30.1 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  29.65 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  31.53 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  32.81 
 
 
688 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  31.34 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  32 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  32.84 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  31.52 
 
 
210 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  29.15 
 
 
210 aa  89  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  32.65 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  31.03 
 
 
214 aa  88.6  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  29.29 
 
 
215 aa  88.6  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  31.5 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  33.96 
 
 
212 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  34.65 
 
 
210 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  31.6 
 
 
209 aa  87.8  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  31.12 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  30.26 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33.49 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  29.85 
 
 
205 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  29.29 
 
 
281 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  28.86 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  29.7 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  28.86 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  31.28 
 
 
901 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  28.86 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  31.47 
 
 
703 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  29.85 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  28.86 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  28.86 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  32.32 
 
 
705 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  30.77 
 
 
707 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  28.36 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  29.19 
 
 
206 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  28.36 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  33.49 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1094  dTMP kinase  28.79 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  30.95 
 
 
206 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  28.5 
 
 
206 aa  85.5  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  30.95 
 
 
206 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  30.14 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  30 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  29.35 
 
 
206 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  30.95 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  30 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  30.14 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  30.14 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  31.16 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  29.59 
 
 
219 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  33.53 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  28.93 
 
 
671 aa  84.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  26.37 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  29.35 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  31.12 
 
 
205 aa  84.7  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  32.93 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  30.96 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  34.25 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  31.07 
 
 
244 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  32.04 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  28.5 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  34.13 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  29.7 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  29.15 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  29.68 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  35.71 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>