More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1126 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1126  thymidylate kinase  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1271  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1246  thymidylate kinase  48.95 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0268379  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0744  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 194 aa  167  7e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.164492  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0857  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0787  thymidylate kinase  48.42 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0204299  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1287  thymidylate kinase  40.72 
 
 		 194 aa  143  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.310287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0924  thymidylate kinase  43.68 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0893  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.298263  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  32.14 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  34.55 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  34.69 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  32.04 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  28.28 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  33.17 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  30.5 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  32.85 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  30 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  31.41 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  40.15 
 
 		 688 aa  99  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  35.35 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  31.12 
 
 		 216 aa  98.2  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  32.49 
 
 		 213 aa  98.2  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  30.57 
 
 		 901 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  34.36 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  34.93 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  31.5 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  35 
 
 		 210 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  30 
 
 		 705 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 212 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  27.67 
 
 		 215 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  29.9 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  28.5 
 
 		 703 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  28.92 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  29.53 
 
 		 686 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 219 aa  92.8  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  30.96 
 
 		 671 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  31.66 
 
 		 225 aa  92.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  35.12 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  38.41 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  30.69 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 215 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  32.65 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  38.17 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  33.82 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  29.9 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  36.3 
 
 		 662 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  30.2 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  28.35 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  32.21 
 
 		 219 aa  89.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  35.09 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  30.58 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  29.32 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 730 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  28.02 
 
 		 217 aa  89  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  33.13 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  30.81 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  34.93 
 
 		 214 aa  88.2  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  28.5 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.95 
 
 		 686 aa  88.2  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  34.69 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  31.72 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 215 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  33.79 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  30.65 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  31.75 
 
 		 295 aa  87.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  26.77 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  28.27 
 
 		 281 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  30.3 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  29.74 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  33.99 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  28.28 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  27.75 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  31.33 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  28.71 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  32.85 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  32.12 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  35.33 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  29.23 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  34.97 
 
 		 688 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  32.21 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.35 
 
 		 707 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  28.87 
 
 		 210 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  26.13 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  28.06 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  36 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  28 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  36 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 225 aa  84.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  30.5 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  29.85 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  32.65 
 
 		 212 aa  84.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  27.98 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  30.72 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  29.23 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>