More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0857 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0857  thymidylate kinase  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0787  thymidylate kinase  98.96 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0204299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1246  thymidylate kinase  96.88 
 
 		 192 aa  371  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0268379  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0744  thymidylate kinase  63.73 
 
 		 194 aa  240  7.999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.164492  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1271  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 195 aa  174  6e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1126  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 191 aa  167  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0893  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.298263  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1287  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 194 aa  157  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.310287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0924  thymidylate kinase  47.74 
 
 		 195 aa  154  6e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  37.75 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  33.67 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  36.31 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  35.32 
 
 		 209 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  31.12 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  29.5 
 
 		 243 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.34 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  31 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  30.24 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  27.86 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  35.61 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  31.53 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  29.03 
 
 		 730 aa  89  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  31.53 
 
 		 662 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  29.21 
 
 		 686 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  29.7 
 
 		 224 aa  88.2  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  37.88 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  34.78 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  31.1 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  32.18 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  31.19 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  30.26 
 
 		 210 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  29.29 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  30.58 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  37.3 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  29.7 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  34.86 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  27.59 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32 
 
 		 207 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  27.36 
 
 		 221 aa  84.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  34.85 
 
 		 219 aa  84.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  30.69 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  27.8 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  30.54 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  29.86 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  26.79 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  26.9 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  28.37 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  33.69 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  31.25 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  32.04 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  29.56 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  32.83 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.35 
 
 		 686 aa  81.3  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  31.33 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  32.56 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  31 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  28.71 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  30.29 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  27.92 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  34.09 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  33.85 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  29.06 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  29.35 
 
 		 688 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  29.8 
 
 		 688 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  34.92 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1094  dTMP kinase  31.53 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  30.32 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  29.85 
 
 		 707 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  26.6 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  26.6 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  26.92 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  27.94 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  32.56 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  29.7 
 
 		 671 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  33.33 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  37.96 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  28.08 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  29.27 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  27.86 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  33.1 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  34.09 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  37.96 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  28.99 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  26.7 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  28.64 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  33.94 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  28.23 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.1 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  28.23 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  28.23 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  28.23 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  30.3 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>