More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1098 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1271  thymidylate kinase  63.92 
 
 
195 aa  249  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0893  thymidylate kinase  54.69 
 
 
192 aa  204  8e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.298263  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0924  thymidylate kinase  52.82 
 
 
195 aa  198  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1287  thymidylate kinase  49.74 
 
 
194 aa  187  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.310287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1246  thymidylate kinase  47.21 
 
 
192 aa  177  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0268379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0857  thymidylate kinase  45.69 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0787  thymidylate kinase  45.69 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0204299  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0744  thymidylate kinase  46.19 
 
 
194 aa  158  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.164492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1126  thymidylate kinase  43.81 
 
 
191 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  33.82 
 
 
206 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33 
 
 
212 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  34.81 
 
 
234 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  33.82 
 
 
212 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  33.69 
 
 
705 aa  98.6  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  29.61 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  32.83 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  34.22 
 
 
703 aa  98.2  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  31.44 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  32.51 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  33.82 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  32.04 
 
 
219 aa  95.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  32.54 
 
 
215 aa  94.7  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  30.81 
 
 
210 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  30.69 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  31 
 
 
213 aa  93.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  36.27 
 
 
688 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  35.68 
 
 
688 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  39.37 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  31.91 
 
 
243 aa  92.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  34.05 
 
 
686 aa  91.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  31.71 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  33 
 
 
686 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  31.66 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  30.15 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  31.98 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  31.63 
 
 
707 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  32.47 
 
 
224 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  32.02 
 
 
217 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  32 
 
 
671 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  32.57 
 
 
234 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  29.25 
 
 
730 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  38.52 
 
 
221 aa  87  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  33 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  31.09 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  33.5 
 
 
662 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  31.63 
 
 
901 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  33.33 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  27.64 
 
 
212 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  32.32 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  27.64 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  30.85 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  28.28 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  28.86 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  32.14 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  29.35 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  29.85 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  30.15 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  32.84 
 
 
216 aa  82  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  28.22 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  29.7 
 
 
223 aa  82  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  30 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  30.05 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  30.05 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  31.73 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  36.14 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  31.55 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  30.54 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  35.33 
 
 
295 aa  81.3  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  29.38 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  28.36 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  28.72 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  27.23 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  32.12 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  31.58 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  30.05 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  30.05 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  30.05 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  30.05 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  31.96 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  28.79 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  29.56 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  28.93 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  30.5 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  29.56 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  30.69 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  29.06 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  29.32 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  27.27 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  28.14 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  30.2 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  29.38 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  30.73 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  27 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  29.56 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  28.72 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  30.33 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  30.15 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  29.56 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  29.56 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>