More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0924 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0924  thymidylate kinase  100 
 
 		 195 aa  380  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  52.82 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0893  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.298263  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1271  thymidylate kinase  55.15 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1246  thymidylate kinase  48.74 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0268379  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0787  thymidylate kinase  48.24 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0204299  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0857  thymidylate kinase  47.74 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0744  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.164492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1287  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.310287  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1126  thymidylate kinase  43.68 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  38.58 
 
 		 225 aa  111  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  31.55 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  37.56 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  38.73 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  34 
 
 		 209 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  34.62 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.14 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  37.76 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  36.57 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  34.8 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  31.53 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  32.66 
 
 		 243 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  35.54 
 
 		 234 aa  94.4  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  34.95 
 
 		 219 aa  94.4  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  37.19 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  30.5 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  29.21 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  35.34 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  35.64 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  32.35 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  40.45 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  29.44 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  30.2 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  39.1 
 
 		 211 aa  87.8  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 202 aa  87.8  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  29.74 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  38.03 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  26.5 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  39.1 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  29.9 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  29.27 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  29.56 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  34.02 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  34.36 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  32.34 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  29.52 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  38.28 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  36 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  31.98 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  31.31 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  30.41 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  29.52 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  29.5 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  30.81 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  29.85 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  32.94 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  34.05 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  28 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  33.73 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  30.73 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  29.89 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  28.36 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  30.85 
 
 		 686 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  34.45 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  28.29 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  31.53 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  36 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  28.5 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  27.86 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  29.05 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  29.61 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  35.71 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  34.62 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  25.63 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  30.81 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  29.06 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  32.47 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  35.9 
 
 		 688 aa  77.8  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  33.16 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  30.73 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  30.54 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  30.46 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  29.91 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  27.01 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>