142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1069 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  54.26 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  55.2 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  52.31 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  49.33 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  31.08 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  30 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  31.48 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  28.77 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  31.13 
 
 		 241 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  27.91 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  32.89 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  27.62 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  27.62 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  30.17 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  27.62 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  26.55 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  27.57 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  28.77 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  25.56 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  28.19 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  24.84 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  24 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  29.46 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  28.97 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  24.67 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  24.89 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  21.17 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  24.67 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  30.73 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  24.53 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  26.17 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  26.17 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  25 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  22.73 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  23.59 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  28.06 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  24.78 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  21.7 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  22.64 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  21.3 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  27.03 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  23.12 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  29.79 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  26.2 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  26.26 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  25.5 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  23.33 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  31.85 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  24 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  21.33 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  23.45 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  24.89 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  26.07 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  27.59 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  25.88 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  29.13 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  26.98 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  26.83 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  24 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  26.55 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  22.83 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  24.03 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  27.39 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  23.5 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  20.7 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  25.55 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  24.44 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  24.77 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  23.27 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  21.83 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  25.67 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  24.88 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  25.9 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  29.41 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  27.03 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  24.02 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  20.96 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  24.39 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  24.69 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  23.35 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  21.59 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  30.14 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  24.76 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  24.68 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  23.44 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  26.88 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  23.28 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  23.77 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  25.69 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  24.26 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  28.96 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  29.56 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  25.14 
 
 		 686 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  27.52 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  23.92 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>