135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1750 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  100 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  87.5 
 
 		 209 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  76.67 
 
 		 229 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  76.67 
 
 		 210 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  76.19 
 
 		 229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  68.6 
 
 		 214 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  62.18 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  56.44 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  62.63 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  57.69 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  56 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  35.53 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  29.52 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  29.27 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  29.89 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  25 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  29.21 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  25.26 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  32.3 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  29.61 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.57 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  28.74 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  30.86 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  34.03 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  31.58 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  30 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  30.54 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  24.64 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  32 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  31.34 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  32.29 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  31.25 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  38.62 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  32.29 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  29.89 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  37.61 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  28.95 
 
 		 686 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  25.91 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  32.06 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  30.53 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  26.05 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  31.01 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  30.43 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  33.53 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  28.49 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  31.33 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  30.52 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  24.3 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  28.04 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  27.17 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  30.23 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  31.06 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  29.27 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  33.12 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  30.81 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  29.67 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  27.93 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  29.03 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  25.54 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02510  Thymidylate kinase  34.51 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  32.12 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  27.27 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  32.42 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  30.69 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  33.54 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  29.12 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  30 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  25.11 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  31.09 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  30 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  31.55 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  25.97 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  29.33 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  31.18 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  26.32 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  26.99 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  26.63 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  30.41 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  29.53 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  30.94 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  26.74 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  28.34 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  34.71 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  31.03 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  28.85 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  34.03 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  25.62 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  28.34 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  27.36 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  31.87 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  26.85 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0823  thymidylate kinase  32.71 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.142499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>