127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13276 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  68.6 
 
 		 211 aa  248  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  68.12 
 
 		 209 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  66.67 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  65.7 
 
 		 229 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  53.89 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  59.6 
 
 		 211 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  56.94 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  51.76 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  31.63 
 
 		 236 aa  95.5  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  31.07 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  35.45 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  27.27 
 
 		 328 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  29.06 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  31.79 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  29.38 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  25 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  28.73 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.7 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  27.89 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  33.73 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  41.28 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  31.98 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  32.45 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  28.48 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.59 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  35.81 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  30.85 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  38.32 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  32.8 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  30.98 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  33.13 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  33.83 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  30.46 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  37.38 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  29.41 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  30.68 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  31.79 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  32.69 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  31.18 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  31.18 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  30.4 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  31.18 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  32.92 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  31.46 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  28.36 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  26.07 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  35.51 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  27.51 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  25.7 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  28.4 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  30.3 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  36.55 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  30.33 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  35.51 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  28.95 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  26 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  34 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2894  thymidylate kinase  27.91 
 
 		 896 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000324283  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  31.94 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  28.95 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  29.67 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  34.43 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  24.42 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  25.67 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  29.72 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  29.11 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  30.85 
 
 		 703 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  33.55 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  29.55 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  29.55 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  30.69 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  33.55 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  26.47 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  28.88 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  27.51 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  31.02 
 
 		 705 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  32.96 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  27.94 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  23.91 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  31.1 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  26 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  29.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  33.54 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  28.4 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  29.55 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  35.24 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  29.94 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  26.9 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>