12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2894 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2894  thymidylate kinase  100 
 
 		 896 aa  1815    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000324283  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3148  hypothetical protein  23.63 
 
 		 534 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2503  thymidylate kinase-like  27.78 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3969  aminoglycoside phosphotransferase  20.68 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0306189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1174  hypothetical protein  21.99 
 
 		 451 aa  56.2  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1013  hypothetical protein  21.95 
 
 		 400 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1838  hypothetical protein  37.04 
 
 		 420 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0947  hypothetical protein  22.37 
 
 		 410 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0280879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1829  hypothetical protein  25.56 
 
 		 420 aa  48.5  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883056  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  26.89 
 
 		 196 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  27.91 
 
 		 214 aa  46.6  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8592  hypothetical protein  40.43 
 
 		 301 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>