47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2503 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2503  thymidylate kinase-like  100 
 
 		 436 aa  867    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2894  thymidylate kinase  27.78 
 
 		 896 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000324283  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0362  thymidylate kinase  30.15 
 
 		 209 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  28.17 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  31.82 
 
 		 205 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  31.62 
 
 		 189 aa  53.5  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  29.55 
 
 		 210 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  33.18 
 
 		 204 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  24.66 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  28.83 
 
 		 196 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  29.33 
 
 		 211 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  30.93 
 
 		 225 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  31.73 
 
 		 193 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  25.36 
 
 		 201 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  25.11 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  29.53 
 
 		 197 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  26.85 
 
 		 205 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4615  thymidylate kinase  28.19 
 
 		 235 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0685  hypothetical protein  32.52 
 
 		 211 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  28.44 
 
 		 212 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  24.88 
 
 		 214 aa  47  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  29.1 
 
 		 703 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  28.02 
 
 		 210 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  25.13 
 
 		 197 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  29.39 
 
 		 225 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  26.15 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  28.69 
 
 		 705 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  26.09 
 
 		 210 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0962  thymidylate kinase  27.6 
 
 		 223 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  28.57 
 
 		 197 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 212 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  26.88 
 
 		 254 aa  43.9  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  25.7 
 
 		 209 aa  43.9  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  26.75 
 
 		 218 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  24.19 
 
 		 211 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1167  thymidylate kinase-like protein  25 
 
 		 217 aa  43.5  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  25 
 
 		 211 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  26.73 
 
 		 217 aa  43.5  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  32.39 
 
 		 213 aa  43.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  32.39 
 
 		 213 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  29.38 
 
 		 230 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 213 aa  43.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 213 aa  43.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 213 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 213 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  32.39 
 
 		 213 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  31.6 
 
 		 688 aa  43.1  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>