36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0362 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0362  thymidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  35.86 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2503  thymidylate kinase-like  32.16 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  26.8 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2353  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  36.78 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  30.67 
 
 		 668 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  34.48 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  34.48 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  25 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  33.33 
 
 		 246 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  46.67 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0797  ABC transporter related  57.14 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  27.07 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  37.65 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  30.86 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  29.79 
 
 		 456 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  29.81 
 
 		 531 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  23.7 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  23.7 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  23.7 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  29.21 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  26.47 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  28.64 
 
 		 250 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  27.96 
 
 		 368 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  27.62 
 
 		 242 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  27.83 
 
 		 259 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3581  thymidylate kinase  31.96 
 
 		 236 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1447  ABC transporter related  39.02 
 
 		 346 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.450122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  32.98 
 
 		 230 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  31.63 
 
 		 531 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  31.63 
 
 		 531 aa  41.6  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.25 
 
 		 632 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>