More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0985 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  100 
 
 
531 aa  1088    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  96.61 
 
 
531 aa  1058    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  82.86 
 
 
531 aa  934    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  74.58 
 
 
531 aa  840    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  95.86 
 
 
531 aa  1049    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  53.3 
 
 
533 aa  593  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  53.12 
 
 
540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  52.17 
 
 
534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  51.8 
 
 
537 aa  571  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  52.36 
 
 
538 aa  566  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
537 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  51.14 
 
 
531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  51.54 
 
 
589 aa  557  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  49.91 
 
 
540 aa  551  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  48.87 
 
 
545 aa  543  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  29.31 
 
 
549 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  29.33 
 
 
573 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  30.1 
 
 
549 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  29.86 
 
 
549 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  29.44 
 
 
549 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  29.97 
 
 
549 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  30.51 
 
 
567 aa  233  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  28.6 
 
 
584 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  29.44 
 
 
549 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  28.57 
 
 
550 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  27.23 
 
 
566 aa  176  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  27.19 
 
 
568 aa  173  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  27.75 
 
 
533 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  26.98 
 
 
552 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.61 
 
 
534 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  26.19 
 
 
536 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  26.08 
 
 
527 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  26.75 
 
 
533 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  26.94 
 
 
525 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  25.3 
 
 
571 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  26.78 
 
 
536 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  26.52 
 
 
551 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  24.79 
 
 
571 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  26.73 
 
 
536 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.28 
 
 
525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  24.82 
 
 
542 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  25.97 
 
 
565 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  26.4 
 
 
555 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  25.14 
 
 
561 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  27.93 
 
 
555 aa  164  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  26.9 
 
 
536 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  25.28 
 
 
534 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  26.25 
 
 
544 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  25.52 
 
 
567 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  26.23 
 
 
536 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  26.9 
 
 
543 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  25.13 
 
 
582 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  26.19 
 
 
629 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  25.14 
 
 
583 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  26.25 
 
 
544 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  25.83 
 
 
631 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  26.73 
 
 
522 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  25.78 
 
 
537 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  25.32 
 
 
573 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  27.11 
 
 
542 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  25.87 
 
 
539 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  26.42 
 
 
549 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  25.6 
 
 
535 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  24.86 
 
 
562 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  25 
 
 
542 aa  158  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  25.74 
 
 
532 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  26.31 
 
 
537 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  26.28 
 
 
541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  24.08 
 
 
575 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  25.78 
 
 
543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  26.05 
 
 
536 aa  157  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  25.78 
 
 
533 aa  157  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25.78 
 
 
543 aa  157  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  25.64 
 
 
543 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  24.45 
 
 
539 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  25.27 
 
 
530 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  24.45 
 
 
539 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  25.27 
 
 
530 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  25.65 
 
 
535 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.74 
 
 
534 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  25.79 
 
 
550 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  24.81 
 
 
530 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  27.07 
 
 
539 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  25.91 
 
 
553 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  25.7 
 
 
543 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  25.37 
 
 
531 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  25.5 
 
 
524 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  24.68 
 
 
537 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  24.64 
 
 
543 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  25.23 
 
 
547 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  25.23 
 
 
555 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  25.41 
 
 
540 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  26.42 
 
 
536 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.41 
 
 
550 aa  153  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  24.71 
 
 
548 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  25.71 
 
 
577 aa  153  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.41 
 
 
541 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  26.45 
 
 
551 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  25 
 
 
527 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  27.04 
 
 
539 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>