More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1040 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  77.6 
 
 		 549 aa  883    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  96.17 
 
 		 549 aa  1066    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  94.54 
 
 		 549 aa  1050    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  100 
 
 		 549 aa  1100    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  70.91 
 
 		 549 aa  775    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  44.25 
 
 		 584 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 		 573 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  42.88 
 
 		 567 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  29.44 
 
 		 531 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  29.36 
 
 		 531 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  29.53 
 
 		 531 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  27.76 
 
 		 545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  29.08 
 
 		 533 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  29.12 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  28.21 
 
 		 531 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  27.66 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  29.82 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  27.76 
 
 		 537 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  28.74 
 
 		 534 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  27.65 
 
 		 589 aa  206  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  28.7 
 
 		 531 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  28.74 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  28.48 
 
 		 540 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  26.79 
 
 		 512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  26.81 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  26.02 
 
 		 912 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  27.46 
 
 		 549 aa  153  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  24.86 
 
 		 532 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  24.87 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  26.82 
 
 		 912 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  25.9 
 
 		 901 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  25.05 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  25.05 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  25.05 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  26.35 
 
 		 912 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  27.22 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2632  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.14 
 
 		 564 aa  147  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  25.93 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  25.99 
 
 		 917 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  23.49 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  23.49 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  25.79 
 
 		 543 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  23.84 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  32.43 
 
 		 360 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  24.56 
 
 		 546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  24.77 
 
 		 912 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.23 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  24.96 
 
 		 540 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  25.31 
 
 		 933 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  26.23 
 
 		 912 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  25.44 
 
 		 553 aa  140  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.68 
 
 		 375 aa  140  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.08 
 
 		 564 aa  140  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  24.16 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  26.49 
 
 		 904 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  25.22 
 
 		 540 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  24.29 
 
 		 544 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  30.04 
 
 		 352 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  24.34 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.93 
 
 		 371 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  23.05 
 
 		 559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  22.6 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  24.55 
 
 		 542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.33 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  25.54 
 
 		 920 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  23.25 
 
 		 616 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  32.09 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.33 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2120  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 243 aa  137  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  24.69 
 
 		 924 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  22.59 
 
 		 555 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.33 
 
 		 347 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  30.07 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25 
 
 		 543 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  24.77 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.68 
 
 		 362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.99 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  24.07 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  24.32 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  24.32 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.39 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  24.01 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  31.76 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  25.13 
 
 		 531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  23.76 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  24.24 
 
 		 921 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  23.99 
 
 		 525 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0697  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  24.5 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29 
 
 		 348 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  23.81 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  24.42 
 
 		 943 aa  134  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0194  ATPase  25.48 
 
 		 532 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  22.98 
 
 		 587 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  23.59 
 
 		 922 aa  133  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0121  ABC transporter related protein  25.95 
 
 		 539 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 351 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 		 351 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 		 351 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  24.96 
 
 		 922 aa  133  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 		 351 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>