More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2344 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  66.6 
 
 		 534 aa  763    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  75.86 
 
 		 540 aa  848    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  100 
 
 		 531 aa  1085    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  62.9 
 
 		 545 aa  716    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  72.02 
 
 		 540 aa  809    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  72.3 
 
 		 537 aa  807    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  62.66 
 
 		 589 aa  731    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  56.98 
 
 		 533 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 537 aa  598  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  52.46 
 
 		 538 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  50.95 
 
 		 531 aa  566  1e-160  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  50.95 
 
 		 531 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  51.14 
 
 		 531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  51.33 
 
 		 531 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  50.38 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  28.04 
 
 		 573 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.03 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  28.87 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  28.2 
 
 		 549 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  28.7 
 
 		 549 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  27.7 
 
 		 549 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  28.19 
 
 		 567 aa  200  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  28.12 
 
 		 527 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  26.37 
 
 		 571 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  27.55 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  26.54 
 
 		 584 aa  191  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  26.02 
 
 		 571 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  26.98 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  27.71 
 
 		 549 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  27.57 
 
 		 548 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  27.49 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  24.87 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  28.55 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  27.3 
 
 		 568 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  26.33 
 
 		 569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  27.16 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  26.15 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  26.65 
 
 		 549 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  28.42 
 
 		 587 aa  179  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  29.33 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  26.47 
 
 		 527 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  27.01 
 
 		 550 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  25.83 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  24.73 
 
 		 567 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.96 
 
 		 534 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  26.29 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  27.26 
 
 		 571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  26.36 
 
 		 531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  28.79 
 
 		 510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  24.78 
 
 		 566 aa  174  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  26.56 
 
 		 537 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  25.97 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.46 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  27.57 
 
 		 534 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  26.05 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  28.14 
 
 		 557 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  26.9 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  25.45 
 
 		 536 aa  171  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  27.68 
 
 		 543 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  26.3 
 
 		 583 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  27.21 
 
 		 543 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  25.45 
 
 		 547 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  25.99 
 
 		 548 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  26.13 
 
 		 546 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  26.34 
 
 		 557 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  26.94 
 
 		 543 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  28.34 
 
 		 547 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  26.32 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  27.47 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  26.49 
 
 		 530 aa  169  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  28.16 
 
 		 551 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.74 
 
 		 555 aa  167  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  26.65 
 
 		 544 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  27.32 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  26.65 
 
 		 541 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  27.05 
 
 		 556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  25.98 
 
 		 867 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 593 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  26.5 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  25.49 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  26.01 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  25.32 
 
 		 563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  25.09 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  26.72 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  25.74 
 
 		 573 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  26.33 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  25.87 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  27.57 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  25.78 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  26.22 
 
 		 563 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  25.77 
 
 		 536 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  24.45 
 
 		 544 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25.43 
 
 		 572 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  27.47 
 
 		 535 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  27.26 
 
 		 559 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  27.26 
 
 		 559 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  26.17 
 
 		 631 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  27.61 
 
 		 540 aa  163  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  26.59 
 
 		 544 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  26.31 
 
 		 535 aa  163  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>