More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1779 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  70.55 
 
 
549 aa  773    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  95.45 
 
 
549 aa  1059    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  100 
 
 
549 aa  1099    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  96.17 
 
 
549 aa  1066    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  77.41 
 
 
549 aa  881    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  44.95 
 
 
584 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 
573 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  43.23 
 
 
567 aa  443  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  29.86 
 
 
531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  29.6 
 
 
531 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  29.24 
 
 
533 aa  227  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  29.95 
 
 
531 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  28.26 
 
 
545 aa  224  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  29.64 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
537 aa  220  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  28.38 
 
 
531 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  29.15 
 
 
534 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  27.7 
 
 
538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  28.2 
 
 
531 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  28.11 
 
 
589 aa  206  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  28.4 
 
 
540 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  27.82 
 
 
537 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  28.81 
 
 
540 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  26.01 
 
 
535 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  25.85 
 
 
912 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  26.76 
 
 
510 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  25.75 
 
 
534 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  25.05 
 
 
532 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  24.17 
 
 
565 aa  147  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  27.14 
 
 
510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  26.86 
 
 
549 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  25.9 
 
 
901 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  25.99 
 
 
917 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  25.45 
 
 
912 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  24.77 
 
 
912 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  25.05 
 
 
543 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  25.45 
 
 
912 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  25.05 
 
 
543 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  25.05 
 
 
543 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  29.64 
 
 
512 aa  141  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  24.73 
 
 
546 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  25.72 
 
 
920 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  24.78 
 
 
540 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  25 
 
 
933 aa  140  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  32.09 
 
 
360 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2632  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.65 
 
 
564 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  24.34 
 
 
525 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  25.95 
 
 
904 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.87 
 
 
374 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0697  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 
536 aa  138  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  25.05 
 
 
912 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  25.04 
 
 
540 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  23.39 
 
 
616 aa  139  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  25.23 
 
 
543 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  24.11 
 
 
544 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25.45 
 
 
543 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  25.18 
 
 
536 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  24.19 
 
 
531 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  31.76 
 
 
363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  22.99 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  24.69 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  29.68 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  24.28 
 
 
605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.68 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  24.6 
 
 
921 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  24.82 
 
 
543 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  23.99 
 
 
525 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.23 
 
 
371 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  24.26 
 
 
540 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0121  ABC transporter related protein  25.99 
 
 
539 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.63 
 
 
347 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.18 
 
 
327 aa  134  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  22.98 
 
 
540 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  22.98 
 
 
540 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0194  ATPase  25.48 
 
 
532 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  34.01 
 
 
340 aa  134  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  24.04 
 
 
906 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  25.13 
 
 
922 aa  133  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  24.15 
 
 
924 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  29.87 
 
 
244 aa  133  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  24.18 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.62 
 
 
375 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  25.31 
 
 
531 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  29.23 
 
 
246 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  23.96 
 
 
922 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.62 
 
 
375 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  29.29 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.29 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  24.91 
 
 
568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  22.89 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  22.89 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.33 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.82 
 
 
907 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.98 
 
 
362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.63 
 
 
914 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  31.42 
 
 
363 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  24.91 
 
 
943 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  34.48 
 
 
342 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  22.55 
 
 
555 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  23.61 
 
 
927 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>