More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0271 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  83.99 
 
 		 531 aa  946    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  96.42 
 
 		 531 aa  1056    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  74.95 
 
 		 531 aa  844    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  100 
 
 		 531 aa  1088    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  96.61 
 
 		 531 aa  1058    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  52.92 
 
 		 533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  53.31 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  52.55 
 
 		 538 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  51.42 
 
 		 537 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 		 537 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  51.61 
 
 		 534 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  52.51 
 
 		 589 aa  569  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  50.95 
 
 		 531 aa  566  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  49.72 
 
 		 540 aa  552  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  49.06 
 
 		 545 aa  545  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  31.36 
 
 		 567 aa  242  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  29.33 
 
 		 573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  29.6 
 
 		 549 aa  233  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  29.91 
 
 		 549 aa  230  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  29.88 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  29.6 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  29.36 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  28.5 
 
 		 584 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  29.41 
 
 		 549 aa  200  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  29.13 
 
 		 550 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  27.29 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.78 
 
 		 568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  25.77 
 
 		 566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  25.79 
 
 		 527 aa  173  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  26.74 
 
 		 536 aa  173  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  24.79 
 
 		 571 aa  170  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  24.92 
 
 		 571 aa  170  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  26.57 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  27.03 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  25.71 
 
 		 534 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  26.75 
 
 		 525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  25.67 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  28.28 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  24.86 
 
 		 542 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.64 
 
 		 571 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  25.31 
 
 		 567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  25.78 
 
 		 593 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  26.23 
 
 		 536 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  26.23 
 
 		 536 aa  163  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  26.18 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  25.28 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.28 
 
 		 525 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  26.15 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  26.66 
 
 		 631 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  26.25 
 
 		 544 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  26.36 
 
 		 629 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  25.91 
 
 		 555 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  26.23 
 
 		 536 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  25.32 
 
 		 583 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  25.28 
 
 		 565 aa  160  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  25.97 
 
 		 535 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  24.91 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.95 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  26.05 
 
 		 536 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  24.58 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  25.32 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.95 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  26.28 
 
 		 541 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  25.87 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  24.58 
 
 		 561 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  25.56 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  25.19 
 
 		 532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  26.25 
 
 		 544 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  26.36 
 
 		 522 aa  157  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  26.1 
 
 		 534 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  24.58 
 
 		 548 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  26.01 
 
 		 535 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  24.09 
 
 		 539 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  26.65 
 
 		 542 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  24.82 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  25.5 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  25.79 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  25.79 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  24.84 
 
 		 647 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  24.04 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  24.78 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  24.64 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  24.91 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  24.91 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  24.81 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  24.73 
 
 		 555 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25.23 
 
 		 543 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  25.99 
 
 		 544 aa  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  26.1 
 
 		 534 aa  153  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  24.68 
 
 		 537 aa  153  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  24.45 
 
 		 542 aa  153  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  23.78 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  25.41 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  25.64 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  23.46 
 
 		 575 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  24.68 
 
 		 540 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  24.68 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  26.13 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  25.73 
 
 		 553 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.41 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>