More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0707 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  56.74 
 
 		 540 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 537 aa  1092    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  67.6 
 
 		 538 aa  778    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  62.38 
 
 		 533 aa  684    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  57.17 
 
 		 537 aa  632  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  56.37 
 
 		 540 aa  631  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  55.41 
 
 		 534 aa  621  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  53.31 
 
 		 531 aa  598  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  51.95 
 
 		 589 aa  598  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  52.87 
 
 		 545 aa  594  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  50.95 
 
 		 531 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  50.95 
 
 		 531 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  50.47 
 
 		 531 aa  569  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  50.94 
 
 		 531 aa  566  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  50.95 
 
 		 531 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  29.37 
 
 		 573 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  29.81 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  29.22 
 
 		 549 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  27.87 
 
 		 584 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  29.39 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.57 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  30.36 
 
 		 567 aa  217  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  27.76 
 
 		 549 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  28.19 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  27 
 
 		 549 aa  176  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  29.24 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  26.24 
 
 		 550 aa  173  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  28.03 
 
 		 915 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  26.42 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  24.83 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  28.42 
 
 		 607 aa  171  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  26.32 
 
 		 543 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  27.94 
 
 		 943 aa  169  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  26.92 
 
 		 914 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  25.29 
 
 		 647 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  24.77 
 
 		 548 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  26.38 
 
 		 582 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  25.18 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  27.19 
 
 		 921 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  25.78 
 
 		 537 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  26.06 
 
 		 550 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  27.08 
 
 		 629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3157  ABC transporter for oligopeptide ATP-binding protein  26.52 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  26.15 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  25.33 
 
 		 566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  25.39 
 
 		 567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 		 571 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  26.4 
 
 		 571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  27.37 
 
 		 597 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  25.14 
 
 		 536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  27.12 
 
 		 536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  24.96 
 
 		 530 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  24.96 
 
 		 530 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  27.75 
 
 		 555 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  27.83 
 
 		 539 aa  163  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  26.57 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  27.42 
 
 		 510 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  26.8 
 
 		 533 aa  163  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  28.22 
 
 		 510 aa  163  9e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  26.32 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  28.03 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  26.82 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  26.55 
 
 		 631 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  27.26 
 
 		 932 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.06 
 
 		 914 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  26.45 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  26.09 
 
 		 573 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3463  ABC transporter related  28.94 
 
 		 546 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.363207  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  26.09 
 
 		 578 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.45 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  26.74 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  26.7 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  26.38 
 
 		 911 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  26.09 
 
 		 901 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  27.19 
 
 		 551 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  27.19 
 
 		 566 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  27.4 
 
 		 629 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  28.49 
 
 		 925 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  28.39 
 
 		 904 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  26.05 
 
 		 901 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  27.21 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  26.25 
 
 		 534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.01 
 
 		 547 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  25.91 
 
 		 901 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  26.88 
 
 		 542 aa  157  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.26 
 
 		 564 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  26.43 
 
 		 935 aa  156  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  24.56 
 
 		 566 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  26.97 
 
 		 901 aa  156  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  25.23 
 
 		 563 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  27.03 
 
 		 544 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  26.92 
 
 		 921 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  27.27 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  26.49 
 
 		 553 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  25.93 
 
 		 912 aa  156  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  26.73 
 
 		 912 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.77 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.13 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  24.46 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>