More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3463 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  69.74 
 
 		 551 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3463  ABC transporter related  100 
 
 		 546 aa  1055    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.363207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  43.18 
 
 		 549 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  41.86 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  44.87 
 
 		 543 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  43.36 
 
 		 542 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  41.9 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  41.7 
 
 		 553 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  42.75 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  46.7 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.58 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 540 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 536 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 536 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  42.91 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  41.3 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  43.74 
 
 		 554 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  44.81 
 
 		 544 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  46.56 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  42.7 
 
 		 570 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  45.94 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  40.22 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  46.13 
 
 		 557 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  42.88 
 
 		 545 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  42.62 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  42.72 
 
 		 531 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 541 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.04 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  40.15 
 
 		 548 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  43.89 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  44.92 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 659 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  42.29 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  39.32 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  45.61 
 
 		 571 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  41.37 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  44.76 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  42.86 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  40.81 
 
 		 543 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  39.22 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  39.76 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  42.51 
 
 		 545 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  41.76 
 
 		 562 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  41.93 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  42.65 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  44.74 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  47.42 
 
 		 566 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  42.23 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40 
 
 		 586 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  41.87 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  42.1 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  44.65 
 
 		 552 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  41.57 
 
 		 571 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  40.15 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  39.82 
 
 		 612 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  42.11 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  40.7 
 
 		 623 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  43.01 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.71 
 
 		 534 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  44.55 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  43.98 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  40.94 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  43.01 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  41.2 
 
 		 567 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  41.24 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  38.28 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.41 
 
 		 545 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  45.22 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.79 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  43.73 
 
 		 545 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.27 
 
 		 584 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  42.13 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  42.57 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 623 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.41 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 607 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  42.03 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  39.81 
 
 		 530 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  43.49 
 
 		 559 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  38.62 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  42.57 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  41.76 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  43.22 
 
 		 603 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  42.99 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  41.17 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  40.88 
 
 		 623 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  40.88 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2225  ABC transporter related  44.79 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.691472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  43.66 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  40.15 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  42.78 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  42.1 
 
 		 545 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  39.76 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 609 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  42.36 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 		 623 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>