More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2065 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 537 aa  1093    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  65.31 
 
 		 589 aa  758    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  72.18 
 
 		 534 aa  813    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  75.51 
 
 		 540 aa  851    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  64.86 
 
 		 545 aa  740    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  75.19 
 
 		 540 aa  847    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  72.3 
 
 		 531 aa  807    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  57.17 
 
 		 537 aa  632  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  56.53 
 
 		 533 aa  615  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  54.43 
 
 		 538 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  52.93 
 
 		 531 aa  588  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  51.42 
 
 		 531 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  52.36 
 
 		 531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  51.8 
 
 		 531 aa  571  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  51.61 
 
 		 531 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.72 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  29.06 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  29.03 
 
 		 584 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  28.42 
 
 		 567 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  28.74 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  27.82 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  27.65 
 
 		 549 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  28.24 
 
 		 568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  27.49 
 
 		 531 aa  176  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  24.27 
 
 		 571 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  28.01 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  25.37 
 
 		 550 aa  173  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  25.62 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  24.66 
 
 		 571 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  25.04 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  28.44 
 
 		 547 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  26.6 
 
 		 534 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  25.86 
 
 		 536 aa  171  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  25.41 
 
 		 549 aa  171  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  29.29 
 
 		 575 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  27.29 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  25.08 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.41 
 
 		 571 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  26.53 
 
 		 545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  27.08 
 
 		 546 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  27.97 
 
 		 557 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.19 
 
 		 564 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  27.72 
 
 		 607 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  27.26 
 
 		 542 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.9 
 
 		 599 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  27.47 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 552 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  26.16 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  27.91 
 
 		 573 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  24.82 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  27.19 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  25.82 
 
 		 569 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  28.05 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  27.26 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.28 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  24.82 
 
 		 550 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  27.3 
 
 		 555 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  26.79 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  24.87 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  26.79 
 
 		 583 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  26.36 
 
 		 533 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  27.16 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  24.69 
 
 		 553 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  25.64 
 
 		 542 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  25.72 
 
 		 544 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  26.23 
 
 		 563 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  27.47 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  26.58 
 
 		 537 aa  160  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  24.16 
 
 		 541 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  25.35 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  24.16 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  25.75 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  24.95 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  26.55 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  26.64 
 
 		 573 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  24.86 
 
 		 555 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  26.88 
 
 		 551 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  27.71 
 
 		 532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  26.6 
 
 		 551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  24.82 
 
 		 539 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  25.83 
 
 		 525 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  26.27 
 
 		 593 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  25.32 
 
 		 537 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  26.06 
 
 		 543 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  25.36 
 
 		 549 aa  157  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  25.36 
 
 		 537 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  24.67 
 
 		 561 aa  156  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  26.23 
 
 		 538 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  26.57 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.56 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  27.06 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  26.9 
 
 		 593 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  26.42 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.07 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  25.49 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  26.94 
 
 		 533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  26.36 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  25.36 
 
 		 536 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  27.05 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  26.13 
 
 		 547 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>