More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1429 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  88.24 
 
 		 565 aa  1008    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  100 
 
 		 561 aa  1145    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0954  ABC transporter related  61.29 
 
 		 578 aa  634  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001519  hitchhiker  0.00500883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  46.46 
 
 		 541 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.3 
 
 		 531 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  47.39 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  47.78 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  47.7 
 
 		 537 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  45.04 
 
 		 553 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.83 
 
 		 525 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  46.34 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  46.56 
 
 		 532 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 530 aa  465  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  46.95 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  46.65 
 
 		 533 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  46.15 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  47.51 
 
 		 537 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  45.2 
 
 		 542 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  45.61 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.84 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  46.94 
 
 		 524 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  45.61 
 
 		 537 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.93 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 539 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 536 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 		 548 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  44.95 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  44.95 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.08 
 
 		 536 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  45.56 
 
 		 545 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  44.98 
 
 		 543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  45.42 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  44.95 
 
 		 538 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  44.04 
 
 		 545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  45.97 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  46.44 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 534 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  46.24 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  46.24 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  46.24 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  43.89 
 
 		 542 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  44.98 
 
 		 542 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  45.29 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  45.57 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  44.98 
 
 		 542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  44.36 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  42.57 
 
 		 543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2225  ABC transporter related  46.14 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.691472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  44.87 
 
 		 533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.6 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  46.15 
 
 		 537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 		 545 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  44.98 
 
 		 542 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  43.49 
 
 		 545 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  43.36 
 
 		 543 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.98 
 
 		 555 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  43.07 
 
 		 542 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  43.77 
 
 		 530 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  45.04 
 
 		 527 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  44.8 
 
 		 527 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  42.02 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  45.68 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  42.94 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  43.46 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  44.75 
 
 		 550 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1949  ABC transporter related  46.85 
 
 		 531 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.267995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  45.22 
 
 		 536 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 		 527 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  45.61 
 
 		 536 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  45.67 
 
 		 543 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  42.25 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 564 aa  438  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  44.04 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  44.89 
 
 		 530 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.94 
 
 		 536 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 		 547 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  44.44 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1234  ABC transporter related  43.29 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 536 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  41.94 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  44.44 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2368  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.06 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0121237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  43.88 
 
 		 555 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  44.69 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 529 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.06 
 
 		 529 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  42.88 
 
 		 534 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  44.64 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2413  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.06 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.137702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  43.76 
 
 		 559 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  43.44 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>