More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1643 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  96.42 
 
 
531 aa  1056    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  95.86 
 
 
531 aa  1049    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  82.49 
 
 
531 aa  936    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  100 
 
 
531 aa  1088    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  75.33 
 
 
531 aa  850    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  53.3 
 
 
533 aa  596  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  54.06 
 
 
540 aa  586  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
537 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  51.61 
 
 
537 aa  570  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  51.8 
 
 
534 aa  569  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  51.98 
 
 
538 aa  570  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  51.33 
 
 
531 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  51.74 
 
 
589 aa  560  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  50.66 
 
 
540 aa  553  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  48.31 
 
 
545 aa  535  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  30.9 
 
 
567 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  29.33 
 
 
573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.96 
 
 
549 aa  230  6e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  29.74 
 
 
549 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  30.02 
 
 
549 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  29.95 
 
 
549 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  29.53 
 
 
549 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  28.6 
 
 
584 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  29.19 
 
 
549 aa  193  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  29.13 
 
 
550 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  26.42 
 
 
566 aa  178  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  26.77 
 
 
527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  25.08 
 
 
571 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  26.74 
 
 
536 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  24.75 
 
 
571 aa  171  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.23 
 
 
568 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  27.49 
 
 
533 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  26.94 
 
 
552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  26.48 
 
 
525 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  28.76 
 
 
555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  26.66 
 
 
593 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  26.41 
 
 
536 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  26.49 
 
 
533 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.91 
 
 
525 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  25.52 
 
 
567 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  26.03 
 
 
551 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.11 
 
 
534 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  24.86 
 
 
542 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  25.69 
 
 
583 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  25.78 
 
 
555 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  25.41 
 
 
530 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  26.12 
 
 
537 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  26.47 
 
 
536 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  25.41 
 
 
536 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  26.27 
 
 
536 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  25.41 
 
 
530 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  25.37 
 
 
531 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  26.23 
 
 
536 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  25.69 
 
 
573 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  25.88 
 
 
544 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  24.77 
 
 
548 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  25.09 
 
 
534 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  25.83 
 
 
629 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  25.65 
 
 
565 aa  157  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  26.48 
 
 
631 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  27.02 
 
 
535 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  25.18 
 
 
543 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  24.95 
 
 
561 aa  156  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  24.77 
 
 
548 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  26.25 
 
 
544 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  27.55 
 
 
542 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  27.07 
 
 
535 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  27.16 
 
 
534 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  26.06 
 
 
537 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  25.98 
 
 
549 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  25.56 
 
 
532 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  25.51 
 
 
530 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  26.86 
 
 
534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 
539 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  26.64 
 
 
541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  25.18 
 
 
542 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  24.82 
 
 
543 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  25.41 
 
 
522 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  27.06 
 
 
543 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  24.49 
 
 
543 aa  153  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  24.91 
 
 
541 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  25.69 
 
 
533 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  24.33 
 
 
647 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.09 
 
 
550 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  24.18 
 
 
539 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  24.18 
 
 
539 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25.23 
 
 
543 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  24.91 
 
 
593 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  25.71 
 
 
549 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  25.73 
 
 
555 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  26.51 
 
 
536 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  24.46 
 
 
582 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  25.23 
 
 
547 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  24.91 
 
 
547 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  23.63 
 
 
575 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  24.72 
 
 
553 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  25.09 
 
 
576 aa  150  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  24.31 
 
 
537 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  26.7 
 
 
539 aa  150  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  26.19 
 
 
564 aa  150  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>