More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0555 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  67.28 
 
 		 540 aa  778    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  78.89 
 
 		 545 aa  892    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  65.31 
 
 		 537 aa  758    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  66.24 
 
 		 540 aa  763    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  66.36 
 
 		 534 aa  767    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  62.66 
 
 		 531 aa  731    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1208    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  54.9 
 
 		 533 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  51.95 
 
 		 537 aa  598  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  52.5 
 
 		 538 aa  588  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  52.51 
 
 		 531 aa  569  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  51.74 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  51.54 
 
 		 531 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  50.1 
 
 		 531 aa  546  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  49.71 
 
 		 531 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  27.9 
 
 		 573 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.9 
 
 		 549 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  28.67 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  28.4 
 
 		 549 aa  206  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  27.65 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  28.11 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  28.45 
 
 		 567 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  26.07 
 
 		 584 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  27.24 
 
 		 549 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.34 
 
 		 571 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  25.49 
 
 		 545 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.12 
 
 		 564 aa  169  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  25.69 
 
 		 539 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  23.77 
 
 		 571 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  25.86 
 
 		 550 aa  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  24.38 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  25.53 
 
 		 566 aa  165  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  26.05 
 
 		 562 aa  163  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  27.14 
 
 		 555 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  27.4 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  25.57 
 
 		 555 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  24.66 
 
 		 549 aa  161  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  25.85 
 
 		 555 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  25.13 
 
 		 536 aa  160  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  25.27 
 
 		 587 aa  160  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  25.6 
 
 		 548 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  25.18 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  25.39 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3463  ABC transporter related  26.46 
 
 		 546 aa  158  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.363207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  25.5 
 
 		 551 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  24.46 
 
 		 567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  25.44 
 
 		 544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  25.39 
 
 		 569 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  25.66 
 
 		 539 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  26.17 
 
 		 593 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  27.07 
 
 		 540 aa  156  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  28.3 
 
 		 904 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  24.74 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.49 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  25.22 
 
 		 534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  25.61 
 
 		 570 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  24.75 
 
 		 594 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  26.81 
 
 		 555 aa  154  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  24.44 
 
 		 539 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  25.2 
 
 		 601 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0954  ABC transporter related  26.53 
 
 		 578 aa  153  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001519  hitchhiker  0.00500883 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  24.78 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  24.31 
 
 		 568 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  25.59 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  24.32 
 
 		 530 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  25.44 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  23.92 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  26.11 
 
 		 518 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  25.58 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  24.32 
 
 		 530 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.2 
 
 		 547 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  25.41 
 
 		 536 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  29.12 
 
 		 547 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  26.86 
 
 		 557 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  24.73 
 
 		 545 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  25 
 
 		 552 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  24.82 
 
 		 544 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  27.19 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  26.37 
 
 		 546 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  25.9 
 
 		 544 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  24.55 
 
 		 542 aa  150  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  24.15 
 
 		 593 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  25.05 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  23.96 
 
 		 556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  24.79 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.29 
 
 		 583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  24.29 
 
 		 538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  27.71 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  24.59 
 
 		 550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  24.06 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25.64 
 
 		 543 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  24.52 
 
 		 547 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  24.56 
 
 		 545 aa  148  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  25.77 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  24.78 
 
 		 552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  24.91 
 
 		 540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  25.73 
 
 		 534 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  24.74 
 
 		 537 aa  147  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  27.85 
 
 		 901 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>